在线作图|在线做UMAP降维分析

UMAP降维分析

UMAP（Uniform Manifold Approximation and Projection）是一种可伸缩的降维方法，在单细胞基因组学中应用广泛，它能最大程度保留原始数据特征的同时大幅度降低特征维数。相对于t-SNE降维方法，UMAP能弥补t-SNE在高维单细胞分析中容易丢失大规模信息(集群间关系)、计算时间较慢以及无法有效地表示非常大的数据集等方面的不足。

TUTU云工具使用
小编和他的小伙伴们开发了一个在线的作图小网站——云图图（www.cloudtutu.com，免费的哦~），操作步骤如下：
①登录网址：https://www.cloudtutu.com/#/index（推荐使用360或者谷歌浏览器）
②输入用户名和密码（小编已经为大家填好了，如果不显示可添加文末二维码添加小编获取），输入验证码后即可登录，不必注册，直接使用，不必担心隐私泄露，是不是诚意满满~
③登录后在工具一栏（全部分析）里找到UMAP分析，点击进入；
④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作。

上传文件

※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理，但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据，以便机器可以识别)
a)准备一个数据矩阵（形式参照示例数据&#x