序列处理工具|Seqkit

大家是否还在为查看连接多个序列文件而感到烦恼呢?是否还在为查找某一段碱基而感到焦虑呢?别担心,有了这款软件这些问题就会自然而然的解决啦,这款软件是什么呢,请让小编为你一一介绍吧~

软件介绍

Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。

优点

1.能够非常全面的处理fasta/q文件,运行速度超快的序列工具
2.支持多平台(Linux/Windows/macOS)使用,是一款轻量级软件
3.可以做到开箱即用(无依赖,无需编译,无需配置)

安装方法
方法一:下载二进制文件(最新的稳定/开发版本)
下载地址:https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/只需要载您的操作系统的压缩可执行文件,并使用tar -zxvf *.tar.gz命令或其他工具解压即可

方法二:通过conda安装(最新稳定版)
conda install -c bioconda seqkit

方法三:通过homebrew安装(最新稳定版)
brew install seqkit

方法四:对于 Go 开发者(最新的稳定/开发版本)
go get -u github.com/shenwei356/seqkit/seqkit

方法五:基于 Docker 的安装(最新的 stable/dev 版本)

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