“ 系统发育分析是我们微生物生态数据分析时一个非常常用的分析项目。前几期，小圆编辑已经跟大家介绍了系统发育树的基本解读及构建方法(戳这里)。然而系统进化树构建完后，我们还需要在美学角度对系统进化树进行修饰，一幅高颜值的配图不仅能提升文章的档次，也更容易获取编辑的青睐。ggtree作为一个实用的系统进化树美化工具，近来受到很多文章青睐。
图片来源：http://dx.doi.org/10.1128/AEM.02307-16
图片来源：http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2017.00543/full
图片来源：http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2017.00456/full
上述所有高大上的树状图都是由同一个软件包做出来的——“ggtree”。ggtree是基于R的强大的树状图修饰工具，支持多种格式的输入文件并与其他R包兼容，可以轻松地实现对树状图的各种后期加工、修饰与美化。让你分分钟做出高大上的树状图，助力你发表TOP期刊，走上
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