不知道大家有没有遇到过这样的问题,基因名重复R语言画热图报错,基因个数太多大多数云平台又没办法画热图。今天给大家介绍一个敲方便的在线方案,上链接:https://www.omicstudio.cn/tool/4。
关于示例数据,有两种获取方式:
1.登陆云平台获取:https://www.omicstudio.cn/doc/1102
2.百度云获取:
链接:链接:https://pan.baidu.com/s/1Q-tl-Sky8N4qbV2d-grk0w;提取码:2bw5
如图所示,第一列为基因名,红框为重复的基因名,后续列为样本列,中间区域为数值。示例数据有4万多行。一般来说,大多数云平台不支持这个数据量的热图绘制;而R语言绘图时又不接受行名重复的数据情况,这种时候本地就需要进行繁琐的数据处理。
首先,这种数据量的热图绘制是为了看数据的总体情况,不用太注意细节,可以三步搞定:
01上传文件:云工具自动检测数据情况![deeec2b4d5dd7c21491c9575619c4e1e.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/80bf1f24f077c13cefe382c799e873d3.jpeg)
![deeec2b4d5dd7c21491c9575619c4e1e.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/80bf1f24f077c13cefe382c799e873d3.jpeg)
非常重要的补充说明
OmicStudio是即时出图的模式,也就是说调整任意一个参数都会重新作图,在数据量少的时候没有关系,但是像本例的数据量,不建议在出图后进行参数调整,即:上传文件前先设置参数。(可以理解为上传文件就是开始分析按钮,一旦上传完成,分析就开始了,没有时间改参数。)
出图后,页面能改动的参数就只有“输出文件名”和“输出图片类型”(图片宽高也不可以)。
更多细节看视频吧。
![9648b6de028354adc40882d23f0da037.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/efac1ab6db834c71f368a4cd15554f8d.png)
![521b134839c24941dd2f60a466eb9f89.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/081ead11f4b61734b0b78034bda2befd.jpeg)
![958a4646ae756182b150f1034b0892bd.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/92ff868f140f7e33f51c62a4c18ac925.png)
![8595bfde4f95cd5172cc5daf6cfb6b3b.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/829adfeb875ee02bd21318d55ee8d797.png)
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