上传文件参数名_“4万行基因名重复的热图,我把好几个云平台画崩了”, “不会的,我教你啊”...

57c8c59d326da7bb69fda2386d9f679a.png

不知道大家有没有遇到过这样的问题,基因名重复R语言画热图报错,基因个数太多大多数云平台又没办法画热图。今天给大家介绍一个敲方便的在线方案,上链接:https://www.omicstudio.cn/tool/4。

b4e2c2373ccc4fe9ac9543cbc658be70.png

关于示例数据,有两种获取方式:

1.登陆云平台获取:https://www.omicstudio.cn/doc/1102

2.百度云获取:

链接:链接:https://pan.baidu.com/s/1Q-tl-Sky8N4qbV2d-grk0w;提取码:2bw5

a2e5e1431672cca3ebe480c6daaa1028.png

5161c05f377244df08ce82effaae390b.png

如图所示,第一列为基因名,红框为重复的基因名,后续列为样本列,中间区域为数值。示例数据有4万多行。一般来说,大多数云平台不支持这个数据量的热图绘制;而R语言绘图时又不接受行名重复的数据情况,这种时候本地就需要进行繁琐的数据处理。

首先,这种数据量的热图绘制是为了看数据的总体情况,不用太注意细节,可以三步搞定:

01上传文件:云工具自动检测数据情况 deeec2b4d5dd7c21491c9575619c4e1e.png

9f909d26907492093fd76301dcb14b01.png

02选择处理方案:检测发现行名重复,可选择一种方案,推荐用默认的。 deeec2b4d5dd7c21491c9575619c4e1e.png

4fb497561dc41e43293e0d8c59b145db.png

03等待约3-5分钟,然后下载

4fee3732ce812d524e5261566ccda64b.png

308d81c3a9363b65188d66e330515e47.png

非常重要的补充说明

OmicStudio是即时出图的模式,也就是说调整任意一个参数都会重新作图,在数据量少的时候没有关系,但是像本例的数据量,不建议在出图后进行参数调整,即:上传文件前先设置参数。(可以理解为上传文件就是开始分析按钮,一旦上传完成,分析就开始了,没有时间改参数。)

出图后,页面能改动的参数就只有“输出文件名”和“输出图片类型”(图片宽高也不可以)。

更多细节看视频吧。

9648b6de028354adc40882d23f0da037.png 关于OmicStudio的更多在线工具学习资料 521b134839c24941dd2f60a466eb9f89.png 958a4646ae756182b150f1034b0892bd.png相关阅读 8595bfde4f95cd5172cc5daf6cfb6b3b.png

在线四步绘制朱樱花网络图-附示例数据

玩转GO和KEGG富集因子图的N种姿势:3种数据处理(含在线筛选条目),3种排序方式,本地交互图片

云平台在线绘制Circos圈图:丰度表类型 | OmicStudio重磅云工具

SCI必备|一分钟就能完成多组学网络关系图,了解下|OmicStudio开挂绘图

SCI必备|高分文章中颜值爆表的circos图不用代码也能画|OmicStudio开挂绘图

2c957329aa3b3be68be0248d84be89c5.png

  • 0
    点赞
  • 1
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值