PacBio三代全长转录组/Iso-Seq技术及案例分析

读透一篇文章比粗读100篇文章都要有用！！！

参考：产品手册

PacBio三代全长转录组有什么优势？

近年来，随着高通量测序技术的发展，转录组测序已经成为研究基因表达调控的主要手段。但二代的转录本重构准确率很低，三代可以直接得到全长转录本，无需组装。可改善基因表达定量结果，发现新的基因和转录异构体，鉴定可变剪切及基因融合现象。

Google第一个就是官网介绍，可以立马理解Iso-Seq的字面意思了。

Iso-Seq 就是 isoform sequencing，中文就是同源异构体测序，其实也是一种 RNA 测序技术。

The challenge of isoform reconstruction（即二代的不足）：

真核组织中，大多数gene是可变剪切的，产生多种transcript isoforms，大大增加了基因组蛋白编码的潜能。

同一个gene产生的可变剪切是大大的不同的，有时甚至会起到相反的效应。

为了研究基因表达，学者们往往使用二代技术，测得的是一些片段，也是就RNA-seq技术。然而，短的RNA-seq 不能跨越全长的转录本，也就不能精准的描绘出 isoform 的不同特性。

三代的核心优势：

Prod