1,RoseTTAFold地位
和Alphafold2并称为“卧龙凤雏”,当然,这俩是真真正正的卧龙凤雏,alphafold2是学术界代表,rosettafold是工业界代表,两个都是用序列来预测蛋白质结构的工具
2,RosseTTAFold的主要组成
其实,RoseTTAFold也是一个深度学习模型,但是我们在下载离线版的时候就会发现,我丢,Rosettafold需要4T的容量吗?
答案是否定的,rossetafold的代码和用到的辅助工具的容量并不大,最大的是rossetafold下载的几个数据库,分别是bfd还有uniref30,另外再加那个啥数据库,一共是有3.7T的容量。
主要组成:
example:运行的例子
input_prep:两个脚本,主要是用来跑msa文件的
network:网络
run_e2e_ver.sh:可以运行的一个例子,这里运行的是单链
run_pyrosetta_ver.sh:可以运行的另一个例子,这里运行的是单链
XXX.yml:环境安装文件
3,安装和测试
可以参照下面博主的链接
https://blog.csdn.net/qq_33953882/article/details/11