筛选数据库_小白学数据挖掘:一文看懂如何用数据库筛选变异位点

2019年即将接近尾声了啦,又到了一年一度总结过去展望未来的关键时期。回望过去,看着年初的计划,小编发出灵魂三问:文章发表了吗?基因测序找安诺了吗?外显子数据库使用对了吗?

不晚,最好的开始时间就是现在,为了答谢广大客户长期以来对安诺优达的衷心支持,小编呕心沥血总结了一套最全的数据库使用教程,帮助大家在年底梳理数据,进一步筛选候选位点,迈向发paper的2020年。 快动下手指点赞收藏起来吧~

基因注释

推荐数据库:

refGene(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/) Ensembl(http://asia.ensembl.org/index.html) UCSC(http://genome.ucsc.edu)

以ensembl数据库为例,在词条中输入要查询的变异位点、基因名称、位置信息或者rs号等,此处需要注意选择参考基因组版本号:hg38(GRCh38)/hg19(GRCh37)。

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举个栗子,输入“rs9793256”,即出现如下界面:

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