Ensemble查看基因的外显子信息，并根据染色体位点判断是第几号外显子

佛系盼毕业

已于 2022-08-22 10:33:09 修改

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文章标签： django python 数据库

于 2021-11-29 21:46:43 首次发布

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Ensemble查看基因的外显子信息，并根据染色体位点判断是第几号外显子

最近遇到一个困扰，就是在分析一些数据的时候，可以分析出它的染色体起始位置和终止位置，但是并不能知道该位点具体位于几号外显子上，整理了下查找步骤。

1）打开ensemble官网

https://useast.ensembl.org/index.html

选择物种，点击进入页面

在这里插入图片描述

2）选择对应的ensemble版本的注释文件，我的分析用的是GRCm38版本的信息，所以我选择了GRCm38的

根据图片步骤进行查询

在这里插入图片描述

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3）搜索结果，点击进入

在这里插入图片描述

4）展示隐藏起来的转录本表格信息

在这里插入图片描述

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5）根据转录本id，点击进入，点击exon信息，即可展示所有的exon信息

在这里插入图片描述

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Ensemble查看基因的外显子信息，并根据染色体位点判断是第几号外显子

Ensemble查看基因的外显子信息，并根据染色体位点判断是第几号外显子最近遇到一个困扰，就是在分析一些数据的时候，可以分析出它的染色体起始位置和终止位置，但是并不能知道该位点具体位于几号外显子上，整理了下查找步骤。1）打开ensemble官网https://useast.ensembl.org/index.html选择物种，点击进入页面2）选择对应的ensemble版本的注释文件，我的分析用的是GRCm38版本的信息，所以我选择了GRCm38的根据图片步骤进行查询3）搜索结果，点击进入
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