森林图怎么分析_森林图(forest plot)怎么看|meta分析

最新推荐文章于 2023-12-22 23:46:05 发布
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森林图是一种在荟萃分析、观察研究和临床试验中常见的图形工具，它包括研究号、两组例数、相对风险及权重等关键元素。通过图形化表示，森林图清晰显示了各研究间的差异和总体效果。
摘要由CSDN通过智能技术生成
Hello， 大家好，我是钟多少玲 这是本公众号的第15篇更文第一次拖更，感谢大家后台(当面)催稿 先碎碎念几句——   十月是繁忙又收获的季节，很幸运期间收到4篇文章 accepted的消息，人生中第一、第二篇meta分析分别发表在Epidemiologic Reviews 以及Lancet Public Health，以后分享这个命题的经验时也能有一点底气。 虽然我一点也不赞成科研是为了发文章(publications)，但是也认为这是把研究成果转化成与同行交流的方式之一，以更好地发挥群体智慧，了解人和世界。往小一点，对研究者来说，也是自我价值受到认可、苦中有乐的时刻吧。谢谢你看到这里那么言归正传，今天给大家分享如何阅读一张 森林图？ Note. 本文预计阅读时间 5分钟

什么是森林图(what)

之前我们分享过开展meta分析的流程，今天主要了解一下meta分析的结果展示——森林图(forest plot)，大概长这样——

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图.森林图示例|Cochrane UK

森林图指的是对不同研究提出同一研究问题，用一系列轴来呈现转换为同一统计量的研究结果。除了meta 分析外，森林图还广泛应用于观察性研究和临床试验，例如风险分析/生存分析等结果。最大的优势是 简
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Meta分析是什么？森林图是什么？森林图如何解读？R语言绘制森林图实战详解：基于lung数据集绘制生存分析的森林图
data+scenario+science+insight
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Meta分析是什么？森林图是什么？森林图如何解读？R语言基于forestplot包可视化森林图实战详解：基于lung数据集绘制生存分析的森林图 目录 Meta分析是什么？森林图是什么？森林图如何解读？R语言基于forestplot包可视化森林图实战详解：基于lung数据集绘制生存分析的森林图 #Meta分析是什么？ #森林图是什么？ #森林图如何解读？ #导入包和数据集 #构建cox比例风险模型 #基础森林图绘制 #森林图美化 Pros and cons of a forest p.
Forest plot for multiple cox regression (Hazard Ratio)
importAlan的博客
07-27 706
library(forestplot) library(survival) library(survminer) setwd("/Users/elijah/Desktop/ICGC/21.multiIndep") rt=read.table("/Users/elijah/Desktop/ICGC/21.multiIndep/indepInput.txt",header=T,sep="\t",check.names=F,row.names=1) multiCox=coxph(Surv(futime...
meta分析森林图解读，实例讲解教你快速学会meta分析森林图解读！
tongjizhiguang的博客
07-01 5288
meta分析森林图里长长短短的横线和形状分别代表了什么？本文以《胰岛素联合低分子肝素治疗高脂血症性急性胰腺炎有效性和安全性的 meta分析》中的森林图为例，进行meta分析森林图解读，解析每一部分所代表的研究意义。一、各部分具体含义二、meta分析森林图解读以文献为例，作者表述为：胃 肠 功 能 恢 复 时 间 共 纳 入 5 项 研究[9，12-13，15-16]，异质性检验结果显示各研究间有异质性，进一步行亚组分析，显示各组仍有异质性，故采用随机效...
森林图怎么分析_图说meta十一：森林图暨RevMan软件使用方法简介
weixin_39619270的博客
10-24 4700
系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析，再用定量或定性合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法。在meta分析受到关注的同时也出现了不同的声音，本系列推送将介绍meta分析的实施步骤，希望帮助了解meta分析，规范meta分析的撰写。本期推送将介绍如何用RevMan软件实现森林图的制作，希望各位老师批评指正。>>>> RevMan图森...
森林图怎么分析_资料｜用Stata怎么做Meta分析？看完你就懂啦
weixin_39663729的博客
11-22 2296
传统的Meta分析软件除了Stata，还有Revman、R、SAS、Meta-Analyst，对于初学者来说，小助理建议还是学Revman，因为菜单操作简单，上手比较快，但是如果你对统计软件或者计算机掌握比较好的，可以直接入手Stata哈哈哈，优秀Stata 不仅小巧轻便，并且功能十分的齐全，一个平平无奇Meta分析的小全才，但是有一个大缺点，就是要付费使用，可是仔细想想这难道不是我们自己的缺点吗...
用于荟萃分析或亚组分析的森林图：绘制用于荟萃分析或亚组分析的森林图-matlab开发
05-30
FORESTPLOT 生成森林图以证明预测变量在多个亚组或跨多个研究中的效果。 森林图是一种图形显示，旨在说明针对同一问题的多项定量科学研究中处理效果的相对强度。 森林图（响应，预测变量，子组，'ArgumentName'，ArgumentValue） response - Nx1 二元向量，其中 N 是患者数量，“1”表示该患者发生了事件/疾病，“0”表示相反，“NaN”表示未知。 当响应是 NxM 矩阵时，每列与一项研究相关联。 如果不同研究中的患者大小不同，则最后用“NaN”填充。 preditor - Nx1 二元向量，其中“1”表示该患者暴露于该治疗或在期望预测值范围内（例如低剂量），“0”表示相反，“NaN”表示未知。 当响应是 NxM 矩阵时，每列与一项研究相关联。如果患者大小在不同研究中不同，则用“NaN”填充。 subgroup - NxM 二元向量，其中“1”表示该患
Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化
weixin_39556044的博客
10-08 3386
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w 更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。 Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。 ​ 之前分享过绘制KM曲线R|生存分析（1），诺莫图展示COX结果Nomogram（诺莫...
python cox模型_Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化
weixin_39610188的博客
02-09 2186
本文首发于“生信补给站”微信公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/2W1W-8JKTM4S4nml3VF51w更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。之前分享过绘制KM曲线R|生存分析(1)，诺莫图展示COX结果Nomogram(诺莫图) | Logis...
细思极恐——R语言forestplot包画meta分析群体药动学常用森林图
我要养只哈士奇的博客
12-06 1万+
细思极恐——R语言forestplot包画meta分析群体药动学常用森林图 今天，笔者想分享一下最近科研作图的经历，最主要的就是用于群体药动学模型建立的森林图，其百度百科定义为： 森林图是以统计指标和统计分析方法为基础，用数值运算结果绘制出的图型。它在平面直角坐标系中，以一条垂直的无效线(横坐标刻度为1或0)为中心，用平行于横轴的多条线段描述了每个被纳入研究的效应量和可信区间(confidence...
R语言绘图 | 高级森林图（Forest Plot）| 多种方法详解 | 代码注释 + 结果解读
weixin_43843918的博客
12-22 1万+
森林图（Forest Plot）用于可视化比较多个研究结果的效应大小和置信区间，通常用于汇总和比较不同研究的结果，特别是在荟萃分析（Meta-Analysis）中。当然，我们之前构建过的也可以用森林图展示结果。森林图提供了一种方式来呈现多个研究的数据，可以帮助我们更好地理解不同研究之间的一致性和差异性，以及整体效应的大小。我们先介绍一下森林图，大家如果不需要的话，也可以跳过这部分直接去看代码实现部分哟！
森林图
weixin_62802660的博客
12-11 9338
将亚组分析的结果用森林图来表示最为常见，此类森林图和上面我们介绍的森林图的意义相似，主要是根据我们分组的一些因素，例如年龄、性别等，把研究分成了不同的亚组，然后在不同亚组下分别进行分析和探讨。反之，当效应量的95% CI均小于0时，即森林图中的横线线段与无效线不相交，且在无效线左侧，可认为因素B组结局指标的均数小于因素A组。当效应量的95% CI均大于0时，即森林图中的横线线段与无效线不相交，且在无效线右侧，可认为因素B组结局指标的均数大于因素A组。60％，占的比重大，所以方块最大；
Meta分析|超详细森林图、漏斗图解读
weixin_60518260的博客
11-27 7867
在结果部分中，heterogeneity（异质性）这一列中的p和I²的值表示了异质性检验的结果，他们的数值大小代表各研究有没有明显的差异。如果效应量是OR,RR,HR这种比值，这条线代表1，横线线段与无效线相交时，提示两组之间结局事件发生率的差异无统计学显著性，如果是RD,MD,SMD这种差值，这条线代表0，可认为两组之间的均数差异无统计学显著性。又称效应框，菱形代表了合并后的效应值和可信区间，其对角线的交点代表合并后的效应值，左右尖端的连线代表了合并后的可信区间，菱形面积代表了合并后的总样本量。
绘制cox生存分析结果的森林图
庐州月光的博客
05-30 4981
欢迎关注”生信修炼手册”!在之前meta分析的文章中我们介绍了森林图的画法，典型的森林图如下所示每一行表示一个study，用errorbar展示log odds ratio值的分布，并将p值和m值标记在图中。森林图主要用于多个study的分析结果的汇总展示。在构建预后模型时，通常会先对所有基因进行单变量cox回归，然后筛选其中显著的基因进行多变量cox回归来建模，对于co...
哈夫曼树详解
weixin_62976968的博客
04-09 3593
权(weight)又称权重：将树中结点赋给一个有着某种含义的数值，(具体的意义根据树使用的场合确定)则这个数值称为该结点的权。在parent=0的树（其实parent不为0是对应根结点的子树）中再选2小造新树。在构造哈夫曼树之前先要了解他的存储结构(哈夫曼树=二叉树)有顺序存储和链式存储。给3号和6号的parent赋值9号(构造出的根结点)并修改9号的左右孩子。结点的带权路径长度：从根结点到该结点之间的路径长度与结点上权的乘积。2.循环1-->n存叶子结点从n+1-->2n-1（总个数）
森林图怎么分析_赠书随机生存森林模型
weixin_39530149的博客
11-20 1218
---文末留言，即可有机会获得赠书噢！随着机器学习的发展，机器学习模型被应用与生存分析的问题上，其中包括生存森林模型。有几个包可以实现随机生存森林，包括ranger，randomForestSRC。本章节是通过ranger实现随机森林模型。随机生存森林模型通过ranger函数构建，ranger()为数据集中的每个观察建立一个模型。下一个代码块使用上面Cox模型中使用的相同数据以及变量构建...
数据可视化——R语言forestplot包绘制组间差异对比图(森林图forest plot)
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zhouhucheng00的博客
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数据可视化——R语言forestplot包绘制组间差异对比图(森林图forest plot) 概述：使用R语言中的forestplot包绘制组间差异对比图。forestplot包本来用于绘制森林图，此处笔者将此用于绘制组间差异对比图，异曲同工，为另一篇博文：数据可视化——R语言ggplot2包绘制组别间指标差异对比图(箱形图及误差条图)提供了另一种实现方案。 森林图(forest plot)常用于...
关于风险回归的Cox 模型构建，森林图(1)
leianuo123的博客
04-10 2129
主要参考的连接是 Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化https://zhuanlan.zhihu.com/p/85675323 R语言：多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包)https://www.jianshu.com/p/52232599fc3b TCGA-8.TCGA的cox模型构建和风险森林图https://www.jianshu.com/p/fcab6cf2c922 需要使用到的R包是 library(survival) li...
R语言：多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包) 森林图 cox可视化
生信小博士的博客
10-15 1万+
计划是介绍一下单因素、多因素、亚组分析、其他类型森林图绘制；列线图部分介绍下基本的变量筛选方法、绘制过程、验证方法（ROC/DCA/校准图/分组比较等）、网页版列线图。其中，1.2是对表的修改，改完表，图就改了；3-5步是通过改字体、线宽等优化的。三-4、字体大小增粗、线条粗细、线型（包括置信区间）、行间距、列间距；三-3、加水平线、垂直辅助线、x周标签、大标题、森林图占比；三-5、颜色、HR方块形状等。三-2、显示所有亚组的患者数。三-1、显示所有变量；三-2、加入患者数目；三-1、显示所有变量。
forestplot包调整森林图的置信区间线条粗细
最新发布
09-09
`forestplot` 是一个用于生成森林图的R语言包，森林图是一种常用的统计图，它展示了单个研究结果及其综合效应的估计值和置信区间。通过调整森林图中置信区间的线条粗细，可以让图形的可读性更强或者更符合特定的展示需求。 在使用`forestplot`包生成森林图时，可以通过`cex`参数来调整置信区间的粗细。`cex`参数是一个缩放因子，用于控制图形中字体大小、符号大小和线条粗细。例如，`cex = 1`将保持默认大小，`cex = 1.5`会使元素大小增加50%，包括置信区间的线条。 下面是一个简单的示例代码，展示如何设置置信区间的粗细： ```R # 载入forestplot包 library(forestplot) # 创建一个用于示例的数据框 data <- data.frame( mean = c(1.5, 2.0, 1.7, 1.4), lower = c(1.0, 1.5, 1.1, 1.0), upper = c(2.0, 2.5, 2.3, 1.8), labeltext = c("A", "B", "C", "D") ) # 绘制森林图并调整置信区间的粗细 forestplot(labeltext = data$labeltext, mean = data$mean, lower = data$lower, upper = data$upper, cex = 1.5) # 这里将置信区间的线条粗细设置为默认的1.5倍 ``` 通过修改`cex`参数的值，你可以根据需要调整置信区间的粗细。
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