Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化

最新推荐文章于 2024-04-26 17:45:22 发布
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分类专栏： 生存分析 生物信息学 肿瘤 文章标签： 生物信息学 森林图 COX 生存分析 forest plot
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更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析的内容，敬请关注小号，给您干货。

Meta分析的结果使用森林图进行可视化展示很常见，其实COX生存分析也能用森林图展示。

​ 之前分享过绘制KM曲线R|生存分析（1），诺莫图展示COX结果Nomogram（诺莫图） | Logistic、Cox生存分析结果可视化，本文将简单的介绍如何使用R-survminer包绘制Cox生存分析结果的森林

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R语言生存分析之COX比例风险模型构建及亚组森林图绘制示例
statistics+insight+vista+power
05-13 390
R语言生存分析之COX比例风险模型构建及亚组森林图绘制示例
绘制cox生存分析结果的森林图
庐州月光的博客
05-30 4839
欢迎关注”生信修炼手册”!在之前meta分析的文章中我们介绍了森林图的画法，典型的森林图如下所示每一行表示一个study，用errorbar展示log odds ratio值的分布，并将p值和m值标记在图中。森林图主要用于多个study的分析结果的汇总展示。在构建预后模型时，通常会先对所有基因进行单变量cox回归，然后筛选其中显著的基因进行多变量cox回归来建模，对于co...
一键搞定COX回归亚组森林图！快速生成顶级SCI论文的高清图！
最新发布
fengbaotongji的博客
04-26 488
现在亚组分析好像越来越流行，无论是观察性研究还是RCT研究，亚组分析一般配备森林图。比如NEJM这张图：比如Lancet这张图：但是在使用R语言绘制时，简单的代码画不出好看的图，好看的图又需要许多代码参数来进行，令人眼花缭乱，对代码小白来说更是无从下手!R语言绘制森林图的美化代码参数（forestploter包）因此，这里推荐大家使用浙江中医药大学郑卫军教授基于R语言开发的风暴统计平台绘制，可以大...
R语言：多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包) 森林图 cox可视化
生信小博士的博客
10-15 1万+
计划是介绍一下单因素、多因素、亚组分析、其他类型森林图绘制；列线图部分介绍下基本的变量筛选方法、绘制过程、验证方法（ROC/DCA/校准图/分组比较等）、网页版列线图。其中，1.2是对表的修改，改完表，图就改了；3-5步是通过改字体、线宽等优化的。三-4、字体大小增粗、线条粗细、线型（包括置信区间）、行间距、列间距；三-3、加水平线、垂直辅助线、x周标签、大标题、森林图占比；三-5、颜色、HR方块形状等。三-2、显示所有亚组的患者数。三-1、显示所有变量；三-2、加入患者数目；三-1、显示所有变量。
关于风险回归的Cox 模型构建，森林图(1)
leianuo123的博客
04-10 2095
主要参考的连接是 Forest plot（森林图） | Cox生存分析可视化https://zhuanlan.zhihu.com/p/85675323 R语言：多因素Cox回归森林图 (基于forestplot包)https://www.jianshu.com/p/52232599fc3b TCGA-8.TCGA的cox模型构建和风险森林图https://www.jianshu.com/p/fcab6cf2c922 需要使用到的R包是 library(survival) li...
python实验期末大作业，数据分析及可视化
06-22
在本实验项目“Python实验期末大作业：数据分析及可视化”中，我们将深入探讨如何使用Python这一强大的编程语言来处理和解读气象数据，特别是在冬季时针对南方与北方两个城市进行对比分析。这个项目主要关注两个核心...
数据可视化-基于Python实现的二手车数据可视化分析.zip
04-04
数据可视化是一种将复杂的数据集转化为易于理解的图形或图像的过程，它在数据分析领域扮演着至关重要的角色。在这个项目中，我们将探讨如何利用Python语言来实现二手车数据的可视化分析。Python作为一个强大的编程...
python数据分析(可视化)_python_数据可视化_数据分析
09-10
Python数据分析与可视化是现代数据科学领域中的核心技能之一。它涉及到使用Python编程语言以及相关的库，如Pandas、NumPy和Matplotlib等，对数据进行处理、探索和展示。在这个过程中，我们首先需要掌握如何在Python...
Python数据分析可视化源码实例
10-03
Python数据分析可视化是现代数据科学中的重要工具，它结合了强大的数据处理库如Pandas和NumPy，以及优秀的可视化库如Matplotlib、Seaborn和Plotly等，为数据科学家提供了高效且直观的数据洞察手段。本资源包含了一...
python数据分析(可视化),python数据分析可视化,Python
09-10
Python数据分析与可视化是现代数据科学领域中的核心技能之一。它涉及到使用Python库处理、分析和展示数据，使得数据背后的模式和洞察力得以清晰展现。在这个过程中，Python的强大在于其丰富的库支持，如Pandas用于...
R语言使用forestploter包绘制单组及双组森林图（2）（附有超详细备注）
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dege857的博客
11-15 3万+
今天我们来介绍一下forestploter包，它等于是在forestplot包的基础上进一步强化功能，制作方法也相对简单一点，而且加强了对图形的精细控制，而且可以绘制单组和多组森林图。Est：效应值，可以是OR或者HR，low：效应值的最低值，可以认为是可信区间的下限，hi：效应值的最高值，可以认为是可信区间的上限。最后绘图，这里我要说一下，ci_column = c(3, 5)是指在第3和5列绘图，est_gp1和est_gp2为一组，est_gp3和est_gp4为一组，其他的依次类推。
R语言绘制森林图
weixin_62802660的博客
12-18 8162
在绘制森林图之前当然需要先下载RStudio软件啦，在下载后需要安装对应的rtool,最后将两者关联起来才能使用其中对应的包，否则只安装了软件很多功能不能使用而且还会报错，这篇文章主要是总结怎么使用forestploter包绘制森林图，本来是想使用python绘制的，但是网络上关于python绘制森林图可参考的文章寥寥无几，所以这次使用R语言进行绘制森林图，而且更加简单，关于森林图的介绍在上篇文章中已经整理了一些资料。（3）使用对应的函数对其中的数据显示各层次进行配置，最后显示。如果将数据传送的代码改成。
森林图
weixin_62802660的博客
12-11 8705
将亚组分析的结果用森林图来表示最为常见，此类森林图和上面我们介绍的森林图的意义相似，主要是根据我们分组的一些因素，例如年龄、性别等，把研究分成了不同的亚组，然后在不同亚组下分别进行分析和探讨。反之，当效应量的95% CI均小于0时，即森林图中的横线线段与无效线不相交，且在无效线左侧，可认为因素B组结局指标的均数小于因素A组。当效应量的95% CI均大于0时，即森林图中的横线线段与无效线不相交，且在无效线右侧，可认为因素B组结局指标的均数大于因素A组。60％，占的比重大，所以方块最大；
【数据可视化应用】绘制森林图（附Python和R语言代码）
wenyusuran的专栏
05-06 6569
森林图(Forest Plot)的简单介绍 森林图(Forest Plot)常用于Meta分析结果展示使用。森林图(可以将观察到的效果、置信区间以及每个研究对象的权重等信息全部表示出来，是一种简单直观地展示单一研究和汇总研究的可视化图表。下面，小编再附上森林图各个绘图元素间关系的解释图： Key Elements of the Forest plot 注：这里小编简单介绍一下，感兴趣的同学可以自行查阅资料哈。 下面小编就介绍下如何使用R和Python绘制森林图(Forest Plot),可视化.
R语言画Cox回归森林图
qq_27390023的博客
03-18 2732
##### cox多因素回归森林图####### #install.packages("tableone") library(tableone) library(survival) ##画森林图的包 library(forestplot) mul_cox<-coxph(Surv(time, status) ~ ., data = lung) mul_cox1 <- summary(mul_cox) colnames(mul_cox1$conf.int) #mul_cox1$coeffici.
forestplot如何画多组森林图
07-29
森林图（Forest plot）是一种用于展示多组数据的统计图形。它通常用于比较和显示多个研究结果的效果估计和置信区间，以便进行综合分析和决策。 要画多组森林图，首先需要收集并整理不同研究的相关数据。每组数据应包括研究的名称、效果估计值（如风险比、比例比、标准化差异等）、效果估计的置信区间和样本量等信息。 在绘制森林图时，需要创建一个坐标轴，其中每个研究占据一个独立的水平位置。在每个水平位置上，可绘制效果估计值的点估计（如点），并用相应的置信区间表示误差范围。还可以使用其他方法，如画线来表示置信区间。 多组森林图的绘制需要考虑一些视觉设计的因素，以使图像清晰易懂。例如，可以使用不同的符号、颜色或形状来区分不同的研究组。在图例中解释每个符号的含义和相应的研究名称，以确保读者正确理解图像。 此外，还可以添加一条垂直线表示整体效应的估计值。这条线可以帮助读者快速比较不同研究的效果估计值与整体效应。 最后，提供图表的标题，并使用文字或箭头标注感兴趣的研究结果或其他重要信息。这有助于读者更好地理解和解释森林图的含义。 通过以上步骤，我们可以制作出清晰明了、易于理解和解释的多组森林图，从而比较和展示多个研究结果的效果估计和置信区间。

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