检查文件上传完成_“我的数据上传NCBI又报错了...” “攻略拿去!”

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在上一期的内容中,我们分享了NCBI测序数据上传的主要步骤和资料填写的注意事项。今天跟大家分享最后一步:原始测序数据的上传以及上传后项目编号的相关类型和含义。

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图1 NCBI测序数据上传步骤

| 原始测序数据上传

完成样本属性和样本测序建库相关信息的填写后,下一步(第7步)即为测序数据上传。当然,如果测序数据量比较大,也可以在申请账号后就开始数据预上传,然后在第7步选择对应文档就可以。预上传和第7步的上传方法一样(图2、图3)。

预上传界面:登录后→ my submissions→ Options to preload data。

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图2 预上传界面

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图3 第7步上传界面

Aspera和FTP都是远程传递大数据量的软件。通过软件将本地地址与远程地址相连,进行文件的高速传输。

我们以Aspera浏览器、Aspera命令行、FTP 3种形式为例介绍三种上传方法,Aspera命令行看起来是代码形式,比较复杂,但其实命令很简单,上传非常快而且稳定,大文件推荐使用Aspera命令行模式。

| 软件安装

1. Aspera软件安装

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