Ubuntu 12.04 安装 gromacs 4.6.5

本文描述了在 Ubuntu 12.04 系统下安装 Gromacs 4.6.5（CPU 版和 GPU版）的详细步骤。

 

编译机器安装的 NV 显卡驱动为 319.82，CUDA 版本是 5.5（安装在/usr/local/cuda目录下），已经正确安装软件 freeglut 和 g++。

 

安装 gromacs 之前，需要先安装 fftw、openmpi 和 cmake。各软件的安装版本和规划要安装的目录如下：

 

 

序号	软件	版本号	安装目录
1	fftw	3.3	/opt/fftw
2	openmpi	1.6.5	/opt/openmpi
3	cmake	2.8.9