药物亲和力相关数据集BindingDB、DAVIS;药物开源数据库源 TDC库

本文介绍了药物亲和力相关的数据集BindingDB和DAVIS,以及药物开源数据库TDC。通过TDC的Python接口,可以便捷地下载和加载这些数据库。TDC提供了丰富的药物数据集,特别适合进行药物亲和力预测等任务。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

参考:
BindingDB :https://www.bindingdb.org/rwd/bind/index.jsp

DAVIS :https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22037378/ ##激酶相关数据库

药物开源数据库源TDC

https://tdcommons.ai/
可以通过python接口快速加载相关数据库;TDC包含很多药物相关数据集,上面亲和力相关的都支持

pip install PyTDC

这么多类型预测下面的数据集可以查看:https://tdcommons.ai/multi_pred_tasks/tcrepitope/
在这里插入图片描述

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from tdc.multi_pred import DTI
data = DTI(name = 'DAVIS')
split = data.get_split()

data.label_distribution()

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