【gromacs学习】-gromacs生成的xvg文件处理

1. gromacs程序运行完之后，可以对结果测定任意两原子之间的距离。

命令如下：
计算JZ4的羟基到102位残基O的距离(找到相应的残基，-select后面为英文双引号)

gmx distance -s md_0_10.tpr -f md_0_10_center.xtc -select "resname JZ4 and name O10 plus resid 102 and name OE1" -oall

2. 生成一dist.xvg文件，如何导入origin进行作图？

新建一文本文档，改名为orgin.bat，内容如下：

@echooff
start/max %~dp0""Origin9_64.exe -r { impasc %1Options.FileStruct.Delimiter:=3; plotgroup iy:=(A,B) type:=linesymb template:=JCP.otp }

exit

特别注意，Origin9_64.exe要跟自己所装版本的origin对应。

由此，origin可以直接打开xvg文件作图了。