python实现pymol批量比对蛋白（align）

！！！发现个问题，运行align多次后RMSD数值会变，得重启服务后以第一次为准！！！
利用python实现pymol批量比对蛋白，固定其中一个蛋白比对其他蛋白

安装

我用的jupyter在Windows环境编辑，从anaconda安装，但是如果用pip install ipymol在jupyter里安装pymol，是无法用import pymol正常导入的。解决方法是Ctrl + R，输入“cmd”，进入命令提示符，用conda install -c schrodinger pymol安装。

运行

import pymol
from pymol import cmd // 导入pymol中cmd功能
import os // 导入os模块，实现读写本地文件

// .pdb文件输入路径
input_dir = "C:/Users/Hypo/Desktop/123"
// 读取pdb文件
pdb_files = [f for f in os.listdir(input_dir) if f.endswith(".pdb")]
// 将pdb载入至pymol
for pd