Gromacs中遇到的各种报错以及警告合集

已于 2024-04-15 22:23:53 修改
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文章标签： 材料工程 模拟退火算法
于 2023-12-08 22:39:18 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43011746/article/details/134888505
版权

警告

1.Bondtype Angle was defined previously

原因：CA N2 H3定义了两遍在forcefield.itp和ffbonded.itp文件中

解决方法：注销ffbond.itp中的此键

2.警告：

Atomtype Au+ not found

解决方法: 首先在atomtype.rtp中添加原子，然后还要在ffnobond.rtp文件中添加Esp和Beta的数据。

3.警告：

ERROR 1 [file tip3p.itp, line 7]:
  Atomtype opls_111 not found

就是这两个规则重复定义了，需要注释掉一个

四年级二班
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