警告
1.Bondtype Angle was defined previously
原因:CA N2 H3定义了两遍在forcefield.itp和ffbonded.itp文件中
解决方法:注销ffbond.itp中的此键
2.警告:
Atomtype Au+ not found
解决方法: 首先在atomtype.rtp中添加原子,然后还要在ffnobond.rtp文件中添加Esp和Beta的数据。
3.警告:
ERROR 1 [file tip3p.itp, line 7]:
Atomtype opls_111 not found
就是这两个规则重复定义了,需要注释掉一个