circos 可视化手册- colors 篇

本文介绍了Circos软件中的颜色配置,包括RGB、HSV、LCH三种颜色体系,以及预定义的颜色梯度和配置文件,如colors.brewer.conf、colors.ucsc.conf、colors.hsv.conf。此外,还展示了染色体和band对应的颜色定义,帮助用户更好地定制视觉效果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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颜色属性是circos中使用频率最高的属性,由colors这个block进行设置,默认的配置文件为etc/circos.conf

circos中,每种颜色都有一个唯一的name,通过这个name来调用该颜色值。配置文件中定义的就是各种颜色的值

在定义颜色值时,有一下3种方式

  1. rgb
  2. hsv
  3. lch

上述三种方式对应三套不同的颜色体系,rgb对应RGB色彩模式,通过R(red), G(green), B(blue) 3原色的叠加来得到各种颜色,每个原色的取值范围为0-255;hsv对应HSV颜色模型,H代表色调,取值范围为0-360,S代表饱和度,取值范围为0-1,V代表明度,取值范围为0-1;lch对应LCH颜色空间,L代表亮度,C代表彩度,H代表色相,其中RGB模型运用最广泛,只要掌握这个模型即可

颜色定义的写法如下:

red = 255,0,0
red = rgb(255,0,0)
red = hsv(0,1,1)
red = lch(54,105,40)

默认使用rgb颜色体系,当然也可以通过函数指定对应的颜色体系。

对于常见的颜色,比如red, bl

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