JASPAR:转录因子motif数据库

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JASPAR是一个免费公开的转录因子数据库，在该数据库中收录了转录因子的mitif信息，可以用来预测转录因子与序列的结合区域。网址如下

http://jaspar.genereg.net/

在该数据库中，提供了以下9种不同来源和类别的转录因子信息

1. JASPAR CORE

该类别下都是从文献中收集的，有实验证据支持的真核生物转录因子motif信息，而且经过了人工核对，是一个非冗余的，高质量的转录因子motif数据库，所以也是整个数据库中的核心。

由于其高质量量，非冗余等特性，通常情况下，该类别信息都是我们的第一选择。每个motif编号以MA开头，示意如下

2. Collection CNE

该数据集包含了233个调控人类非编码基因的转录因子motif信息，是根据Xie et al. (PNAS 2007)文章中的数据收集整理的，编号以CN开头，示意如下

3. Collection FAM

该类别下保存的是转录因子的类别class信息，多个转录因子可以拥有相同的调控序列，将调控序列相同的转录因子归为一类。每个class的编号以