footprintDB:综合性的转录因子数据库

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对于转录因子而言，相关的信息有以下几种

1. transcription factors

2. DNA motifs

3. DNA binding sites

4. target genes

transcription factors表示转录因子的名称，对应的基因，家族，序列等基本信息，DNA motifs代表该转录因子结合区域的保守模式，DNA binding sites代表该转录因子实际的结合区域，target  genes代表转录因子调控的靶基因。

footprintDB是一个综合性的转录因子数据库，通过整合多个转录因子相关的数据库，最终构建出一个非冗余的数据集，在该数据库中，存储了transcription factors, DNA motifs, DNA binding sites3种信息。网址如如下

http://floresta.eead.csic.es/footprintdb/index.php

该数据库整合了以下19个数据库中的信息

1. JASPAR

2. CISBP

3. 3D-footprint

4. HT-SELEX2

5. UniPROBE

6. HOCOMOCO

7. AthalianaCistrome

8. HumanTF

9. HumanTF2

10. AthaMYB

11. FlyZinFinger

12. SMIL