LncBook:综合性的人类lncRNA数据库

LncBook是一个综合性的lncRNA数据库,涵盖了277044个lncRNA的详细信息,包括功能、疾病关联、表达量、甲基化状态、SNP位点和lncRNA-miRNA相互作用。数据库提供了多种工具,如Blast、LGC和Conversion,支持lncRNA研究和分析。此外,它特别关注功能注释的lncRNA,为lncRNA功能研究提供宝贵资源。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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随着lncRNA研究的发展,lncRNA的数量越来越多,但是拥有功能注释的lncRNA只占了其中很小一部分。为了更好的开展lncRNA的功能研究,科学家收集文献中人类lncRNA相关的数据,包括了表达量,相关疾病,甲基化位点,SNP位点,功能描述等信息,并整理成了数据库LncBook, 网址如下

http://bigd.big.ac.cn/lncbook/index

该数据库中包含以下8种lncRNA相关信息

1. LncRNAs

共包含277044个lncRNA, 既有实验验证的lncRNA,也有软件预测的lncRNA,收集了来自Gencode, RefSeq, Noncode, Lncipedia, MiTranscriptome 等数据库中的lncRNA, 在预测lncRNA时,采用了CPAT, PLEK, LGC3个软件结果的交集。

这部分提供lncRNA的ID, 染色体位置,长度,外显子个数,类型等基本信息,示意如下

2.  Featured LncR
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