LncMAP:lncRNA-TF-gene调控网络数据库

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转录调控对疾病的影响是研究的热点之一,除了研究转录因子和TF之间这种直接的调控作用,科学家发发现lncRNA也可以参与转录调控,通过lncRNA-TF-gene的调控网络。
LncMAP数据库收集整理了20多种肿瘤中相关的lncRNA-TF-gene调控网络信息,网址如下

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/LncMAP/index.jsp

肿瘤类型和对应的lncRNA调控网络数量统计图示如下

通过LncRNA-TF-Gene Tripet可以检索对应的调控网络,检索框如下所示

选择肿瘤类型,然后输入lncRNA, TF, Target gene中的任意一个都可以,以PVT1这个lncRNA为例,检索结果如下

每一行代表一个lncRNA-TF-gene三角关系对,点击Network按钮,可以查看对应的网络图,示意如下

点击more按钮,可以查看详细信息,包括lncRNA,TF, gene在肿瘤患者和正常人中的表达量

与之类似的,还提供了Drug-lncRNA, TF-gene之间的相互作用网络,通过对应的导航栏都可以方便的查找结果,展示形式和上面的lnRNA-TF-gene基本相同。

数据库中的信息是开发团队基于TCGA数据库中的转录组表达谱数据分析得到的,通过在线服务,我们可以方便的查看所有的lncRNA-TF-Gene调控网络结果。

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### 回答1: lncRNA-miRNA-mRNA网络是涉及到长链非编码RNA、microRNA和mRNA之间相互调控的一种复杂网络结构。该网络lncRNA可以通过与microRNA相互作用来调节mRNA的表达,从而影响细胞的生物学行为。这种网络结构在生物学研究中具有重要的意义,是唤起人们对于基因调控机制的深入研究的重要方向之一。 ### 回答2: lncRNA-miRNA-mRNA网络是基因调控中的一个重要机制,它可以在转录后水平精确地调节基因表达,并在许多生物学过程中发挥关键作用。在这个网络中,前体长非编码RNA(lncRNA)作为调节剂和中介器,通过与微小RNA(miRNA)相互作用来影响靶向基因的表达。miRNA是一类短的RNA序列,它们结合到靶向mRNA的3'未翻译区(3' UTR)上,导致mRNA的降解或抑制转录,从而影响基因表达。因此,lncRNA通过与miRNA相互作用,可以增强或抑制miRNA对目标mRNA的靶向作用,从而进一步调节基因表达。 lncRNA-miRNA-mRNA网络在许多生物学过程中发挥重要作用,包括细胞增殖、分化、转移、凋亡和移动等。lncRNA-miRNA-mRNA网络还可以在人类疾病的发病机制中发挥重要作用,包括癌症和神经系统疾病等。例如,在癌症中,lncRNA可以作为miRNA的“蚂蚁器”来调节miRNA对肿瘤抑制基因的调控作用,从而促进肿瘤的增殖和转移。因此,lncRNA-miRNA-mRNA网络已成为研究细胞生物学和疾病发生机制的重要研究方向。 总的来说,lncRNA-miRNA-mRNA网络是一种复杂的基因表达调控机制,在不同的生物学过程和疾病中扮演着重要角色,深入研究该网络调控机制和生物学功能可以为疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。 ### 回答3: Lncrna-mirna-mrna网络是近年来生物学领域中的研究热点,它是由长非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)组成的分子网络。该网络被广泛地应用于基因表达调控、疾病诊断和治疗等方面。 在该网络中,lncRNA通过与miRNA的结合,从而抑制miRNA的作用,使miRNA无法结合到其作用靶标mRNA上进而抑制该mRNA的表达。与此同时,lncRNA还可以通过与mRNA的结合,调控mRNA的转录、剪接、聚合和转运等关键步骤,影响mRNA的表达水平和功能。因此,该网络可以实现复杂的调控机制。 近年来,越来越多的实验研究证明了该网络在多种疾病中的重要作用,如心血管疾病、癌症、神经退行性疾病等。同时,该网络也被应用于疾病的诊断和治疗方面,在疾病早期诊断和个体化治疗方面具有很大潜力。 值得注意的是,虽然这一网络已经得到了广泛的应用和研究,但是对于其机制和调控方式仍有很多未知之处,需要进一步深入的研究。另外,应用该网络在疾病诊断和治疗方面还存在许多技术和方法上的局限性,需要不断融入新的技术和探索新的方法。 总之,lncRNA-miRNA-mRNA网络是一个十分重要的分子网络,在基因调控和疾病诊断治疗方面具有广泛的应用前景。未来还需加强研究,以期在临床治疗方面发挥更大的作用。
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