EVLncRNAs:最大的实验验证过的lncRNA数据库

欢迎关注”生信修炼手册”!

在已有的lncRNA数据库中,包含了两种类型的lncRNA, 一种是实验手段证实过的lncRNA, 另外一种是软件预测出来的lncRNA,其中软件预测的结果是存在很多的假阳性的。

EVlncRNAs是目前最大的实验验证的lncRNA数据库,收录了来自动物,植物,微生物共77个物种,1543个lncRNA, 除了染色体位置,外显子个数,长度等基本信息外,还提供了lncRNA相关的疾病,lncRNA功能注释,lncRNA与其他分子的相互作用等信息,数据库网址如下

http://biophy.dzu.edu.cn/EVLncRNAs/

H19这个lncRNA为例,包含了以下几种信息

1. 基本信息

包括lncRNA id, name, 染色体定位,外显子个数,转录本编号等基本信息,示意如下

2. lncRNA相关疾病

通过整合了lncRNADisease, lnc2Cancer等数据库以及已经发表的文献,提供了lncRNA相关的疾病信息,示意如下

3.  功能注释

4.  相互作用

包括了lncRNA与miRNA, protein, TF等相互作用信息,示意如下

该数据库中的信息是免费下载的,示意如下

·end·

—如果喜欢,快分享给你的朋友们吧—

扫描关注微信号,更多精彩内容等着你!

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值