GEPIA:TCGA和GTEx表达谱数据分析平台

GEPIA是一个在线平台,整合TCGA和GTEx数据,提供基因表达谱分析和丰富的可视化功能。用户可通过搜索框查询基因,查看基因在不同组织的表达情况、肿瘤与正常样本的差异表达、生存分析、相关性分析及PCA。平台操作简单,适合肿瘤研究中的数据挖掘和初步分析。
摘要由CSDN通过智能技术生成

欢迎关注”生信修炼手册”!

GEPIA整合了来自TCGA和GTEx项目中的基因表达谱数据,提供了多种数据分析和可视化功能,操作简单,方便广大科研人员对肿瘤的表达谱数据进行挖掘,对应的文章发表在Nucleic Acids Research,链接如下

https://academic.oup.com/nar/article/45/W1/W98/3605636

该web平台的网址如下

http://gepia.cancer-pku.cn/index.html

通过首页的检索框,可以快速检索单个基因的相关结果

TP53为例,结果如下

1. General

这部分对基因的功能进行了简单描述,同时给出相关数据库的链接,示意如下


右侧的body map中红色代表肿瘤患者, 绿色代表正常个体,给出了在不同组织中的表达量,颜色越深,对应的表达量越高,鼠标点击可以看到具体的表达量。

还给出了不同肿瘤中正常样本和肿瘤样本中表达量的对比图,每个点代表一个样本,如下所示

评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值