使用cBioPortal查看TCGA肿瘤数据

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cBioPortal整合了来自TCGA,CCLE以及几个独立的大型肿瘤研究项目的数据，构建了一个易于使用的网站，不需要有深厚的计算机功底，也可以通过该网站查询，分析，可视化肿瘤的相关结果。

针对该网站的使用，官方专门发布了对应的文章，链接如下

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4160307/

该网站的网址如下

http://www.cbioportal.org/

在该网站中，存储了肿瘤的多种组学数据，列表如下

1. somatic mutations

2. DNA copy-number alterations(CNAs)

3. mRNA/miRNA expression

4. DNA methylation

5. protein abundance

6. phosphoprotein abundance

将每个肿瘤研究的相关结果作为一个study, 可以方便的针对一个或者多个study的数据进行探究。以探究单个study的分析结果为例，过程如下

需要经过4个步骤，第一步选择感兴趣的study,第二步选择需要查看的组学数据，在一个study中，可以包含突变， CNV, 表达谱等