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驱动基因的识别是肿瘤基因组学研究中的一项重要内容,NCG是一个肿瘤驱动基因的数据库,目前最新版本为v6.0, 网址如下
http://ncg.kcl.ac.uk/index.php
共收录了2372个驱动基因,分成以下两个部分
711 Known cancer genes
1661 Candidate cancer genes
对于每个基因,提供了多种注释信息,以PTEN
为例,包含以下几个部分的注释信息
1. General information
提供了基因在NCBI, Ensembl, Uniprot等数据库的链接,同时也提供了蛋白结构域SMART, 体细胞突变COSMC,相关疾病OMIM
等数据库的链接,示意如下
2. Cancer Information
提供了该基因相关的肿瘤信息,以COSMIC数据库和对应的pubmed文献链接的形式查看,示意如下
3. Orthology
提供了该基因在不同物种间的同源信息,示意如下