NCG:肿瘤驱动基因数据库

NCG是一款专注于肿瘤驱动基因的数据库,收录2372个基因,包括711个已知癌症基因和1661个候选基因。数据库提供详细信息,如基因注释、同源性、表达量、功能、互作网络和miRNA-gene调控等,助力肿瘤基因组学研究。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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驱动基因的识别是肿瘤基因组学研究中的一项重要内容,NCG是一个肿瘤驱动基因的数据库,目前最新版本为v6.0, 网址如下

http://ncg.kcl.ac.uk/index.php

共收录了2372个驱动基因,分成以下两个部分

  1. 711 Known cancer genes

  2. 1661 Candidate cancer genes

对于每个基因,提供了多种注释信息,以PTEN为例,包含以下几个部分的注释信息

1. General information

提供了基因在NCBI, Ensembl, Uniprot等数据库的链接,同时也提供了蛋白结构域SMART, 体细胞突变COSMC,相关疾病OMIM等数据库的链接,示意如下

2.  Cancer Information

提供了该基因相关的肿瘤信息,以COSMIC数据库和对应的pubmed文献链接的形式查看,示意如下

3. Orthology

提供了该基因在不同物种间的同源信息,示意如下

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