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CCLE全称如下
Cancer Cell Line Encyclopedia
是由Broad Institute研究所牵头发起的一项肿瘤基因组学研究项目,收集整理了1000多个肿瘤细胞系的组学数据,包含了以下类别
CNV profiles
DNA fusion profiles
gene/miRNA Expression profiles
Mutation profiles
DNA methylation profiles
reverse phase protein array(RPPA) profiles
该数据库的网址如下
https://portals.broadinstitute.org/ccle
简单注册之后就可以查看其中的数据,最新版本共包含了1457个细胞系的相关数据,示意如下
通过首页的检索按钮,可以根据基因或者细胞系进行检索,以TP53
为例,示意如下
检索结果包含以下几个部分