TCGA样本编号

TCGA样本编号为：TCGA - A6 - 6650 - 01A - 11R - 1774 - 07

详解：
TCGA：Project 项目名称
A6：TSS 组织来源代码
6650：Participant 科研参与者
01A：样本类型，前面的数字1-9为肿瘤，10-29为正常或癌旁样本。字母代表质量，A为佳，B次之。
11R：Portion, 同属于一个患者组织的不同部分的顺序编号，同一组织会分割为100-120mg的部分，分别使用。R为分析的分子类型。
174：Plate, 在一系列96孔板中的顺序，值大表示制板越晚。即为去除batch effect时的batch依据。
07：Center, 测序或鉴定中心编码.

另附：TCGA中数据下载

ps：各种癌症缩写
ACC 腺样囊性癌
BLCA 膀胱癌
BRCA 乳腺癌
CESC 宫颈鳞状细胞癌
CHOL 胆癌
COAD 结肠癌
DLBC 淋巴癌
ESCA 食管癌
GBMLGG 脑癌
HNSC 头颈部鳞癌
KICH 嫌色细胞癌
KIRC 肾透明细胞癌
KIRP 乳头状肾细胞癌
LAML 骨髓癌
LIHC 肝癌
LUAD 肺腺癌
LUSC 肺鳞状细胞癌
MESO 胸膜癌
OV 卵巢癌
PAAD 胰腺癌
PCPG 肾上腺癌
PRAD 前列腺癌
READ 直肠癌
SARC 软组织癌
SKCM 皮肤癌
STAD 胃癌
TGCT 睾丸癌
THCA 甲状腺癌
THYM 胸腺癌
UCEC 子宫内膜癌
UCS 子宫癌
UVM 眼癌