生信豆芽菜-单基因与HRD评分的关系

最新推荐文章于 2024-10-30 14:07:06 发布
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文章标签： r语言 数据挖掘 数据分析
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木之如水
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生信豆芽菜-单基因与免疫浸润的关系
weixin_43949246的博客
08-14 148
单基因与免疫浸润
生信豆芽菜-单基因与免疫炎症的关系
weixin_43949246的博客
08-14 133
通过KEGG官网下载免疫验证相关通路，并使用ssGSEA的方法计算免疫验证相关通路的评分，最后计算与该基因相关性。提交后等待运行成功即可，还可以关注：豆芽数据分析。
生信豆芽菜-ssGSEA预测免疫细胞评分
weixin_43949246的博客
08-15 490
当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据，也可以关注：豆芽数据分析。这里我们通过免疫细胞的特征基因集使用ssGSEA的方法预测患者免疫细胞的评分。2、选择不同的基因集，这里提供了两个基因集可以选择其中之一。一个全编码蛋白的表达谱基因，其中行为基因，列为样本。一、ssGSEA预测免疫细胞评分介绍。第一列为基因为行名，不能重复。
生信豆芽菜-机器学习筛选特征基因
weixin_43949246的博客
09-06 613
当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据，也可以关注：豆芽数据分析。第二个文件：分组信息，第一列为样本名，第二列为患者分组。这里选择是lasso，每一个基因对于分组的贡献。2、选择机器学习的方法，然后提交等待结果即可。第一个文件：特征表达数据。第三个文件：分析基因名。
生信豆芽菜-EMT评分的计算
weixin_43949246的博客
08-23 273
当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据，也可以关注：豆芽数据分析。2、提交后，等待运行成功即可下载。表达谱数据，行为基因，列为样本。
生信豆芽菜-ImmuCellAI预测24种免疫评分
weixin_43949246的博客
08-15 570
ImmuneCellAI能够估计18种T细胞和6种其他类型免疫细胞（B细胞，NK细胞，Monocyte细胞，Macrophage细胞，Neutrophil细胞和DC细胞.）的比例，同时可以预测患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应，如果有分组信息，使用传统的方差检验的方法比较不同分组下各个免疫细胞比例的差异。当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据,也可以关注：豆芽数据分析。一个全编码蛋白的表达谱基因，其中行为基因，列为样本。一、ImmuCellAI预测24种免疫评分简介。
生信豆芽菜-oncoPredict预测药物的敏感性
weixin_43949246的博客
08-17 843
当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据，也可以关注：豆芽数据分析。准备一个行为基因，列为样本的表达谱矩阵即可。2、选择训练集数据库，提交等待运行成功即可。
生信豆芽菜-ESTIMATE预测免疫评分
weixin_43949246的博客
08-15 1037
它通过分析基因表达数据来估计肿瘤组织中间质细胞和免疫细胞的相对丰度，从而提供免疫评分的预测。它可以帮助研究人员预测肿瘤样本中免疫细胞的存在程度，评估免疫细胞的浸润水平，从而为研究肿瘤免疫生物学特征、预测患者对免疫治疗的反应以及指导治疗方案提供有价值的信息。根据ESTIMATE的计算结果，可以得到肿瘤样本的免疫评分预测。该评分反映了肿瘤样本中免疫细胞和间质细胞的丰度，可用于评估免疫细胞浸润情况和免疫反应水平。当然，如果不清楚数据是什么样的，可以选择下载我们的示例数据，还可以关注：豆芽数据分析。
R语言---生信分析---ssGSEA基因集富集分析、免疫浸润
dujidan的博客
12-14 3364
R语言---生信分析---ssGSEA基因集富集分析、免疫浸润
华中科技大学生信专业课件--基因芯片
07-09
华中科技大学生信专业课件.基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列...
生信知识点-串讲-富集分析_R生信_生物信息_富集分析_R富集分析_生信分析_
10-02
首先，富集分析的目标是检测在实验组中显著上调或下调的基因集合是否与已知的生物学过程、通路或功能注释有关联。这通常涉及到比较实验组和对照组之间的基因差异表达，并对这些差异基因进行功能分类。 R语言提供了...
生信技能48 - 如何获取基因的SNP及RefSeq参考序列命名规则
LittleComputerRobot的博客
06-16 296
基因的SNP及RefSeq参考序列命名规则
【运动的＆足球】足球场地区域图像分割系统源码＆数据集全套：改进yolo11-RFAConv
a4822425的博客
10-29 1100
本项目数据集信息介绍本项目所使用的数据集名为“football boxes”，旨在为改进YOLOv11的足球场地区域图像分割系统提供支持。该数据集包含七个类别，分别为“18Yard Circle”、“18Yard”、“5Yard”、“First Half Central Circle”、“First Half Field”、“Second Half Central Circle”和“Second Half Field”。这些类别涵盖了足球场上不同的关键区域，为模型的训练提供了丰富的样本和多样化的场景。
NewStarCTF2024-Week4-Web-WP
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10-30 1013
打算去改上周的脚本，结果去跑的时候忘了将上次的最后 payload 注释，直接就上周的脚本就跑出来 flag 了，week3 应该是打算考布尔盲注，week4 是时间盲注，所以直接就都打通了。最后 final.php 是一个反序列化的利用，一开始还想绕过过滤的 chocolate，后面发现不需要绕过，并且 url 编码后传入不行，直接传序列化后的内容。又看到另一个下载插件路径可控的，但是插件管理里面并没有看到可以下载插件的地方， 手动构造一下，但是似乎出不了网...
R语言机器学习算法实战系列（十五）随机森林生存预后模型+SHAP值 (Random Survival Forest + SHAP)
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10-30 419
R语言机器学习算法实战系列（十五）随机森林生存预后模型+SHAP值 (Random Survival Forest + SHAP)
rsync异地备份
大虾别跑
10-30 378
rsync异地备份
大数据-198 数据挖掘 机器学习理论 - scikit-learn 归一化 距离的惩罚
永远好奇，无限进步！
10-30 2156
最近邻点距离远近修正在对未知分类过程中，一点一票的规则是 KNN 模型优化的一个重要步骤，也就是说，对于原始分类模型而言，在选取最近的 K 个元素之后，将参考这些点的所属类别，并对其进行简单计数，而在计数的过程中这些点一点一票，这些点每个点对分类目标点的分类过程中影响效力相同。但这实际上不公平的，就算是最近邻的 K 个点，每个点的分类目标点的距离仍然有远近之别，而近的点往往和目标分类点有更大的可能性属于同一类别（该假设也是 KNN 分类模型的基本假设）。真正正确的方式是，先分训练集和测试集，再归一化。
大数据-197 数据挖掘 机器学习理论 - scikit-learn 泛化能力 交叉验证
永远好奇，无限进步！
10-30 1739
在业务中，我们训练数据往往都是以往已经有的历史数据，但我们的测试数据却是新进入系统的数据，我们追求模型的效果，但是追求的是模型在未知数据集上的效果，在陌生的数据集上表现的能力被称为泛化能力，即我们追求的是模型的泛化能力。通常来说，我们认为经过验证集找出最终参数后的模型的泛化能力是增强了的，因此模型在未知数据（测试集）上的效果会更好，但尴尬的是，模型经过交叉验证在验证集上的调参之后，在测试集上的结果没有变好的情况时有发生。所有的交叉验证都是在分割训练集和测试集，只不过侧重的方向不同。
如何使用python轻松入手文本数据分析？
梦在硅谷的博客
10-30 278
如何有效地分析这些文本数据，提取有价值的信息，成为了数据科学领域的重要研究方向。Python作为一种强大的编程语言，凭借其丰富的库和工具，成为文本数据分析的热门选择。通过这些步骤，能够有效地从文本数据中提取有价值的信息。随着技术的不断发展，文本数据分析的应用场景也在不断扩展，未来将会有更多的研究和实践值得探索。以上是关于基于Python的文本数据分析的概述，涵盖了从数据收集到结果评估的各个方面。本文介绍了如何使用Python进行文本数据分析的基本流程，包括数据收集、预处理、特征提取、情感分析和主题建模等。
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