【无标题】

标题read count、标准化

确定gene的表达量就是把一段gene的rna逆转录的cdna打碎成片段,这些小片段会匹配到gene序列上,多少个reads就是counts,就是gene的表达量。但是count受gene长度和测序深度的影响。
样本A中gene的表达量是样本B的两倍,但是这是由测序深度引起的结果,而非真实存在的差异。

样本A中gene的表达量是样本B的两倍,但是这是由测序深度引起的结果,而非真实存在的差异。

在这里插入图片描述

基因X和Y的真实表达量是一致的,但是基因X的reads会比Y的多,这是由于X基因长度更长导致的。

只想了解每个gene被覆盖到的相对reads数,而不做gene长度矫正在这里插入图片描述

都做

在这里插入图片描述

这个人讲的挺好,有例子

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