标题read count、标准化
确定gene的表达量就是把一段gene的rna逆转录的cdna打碎成片段,这些小片段会匹配到gene序列上,多少个reads就是counts,就是gene的表达量。但是count受gene长度和测序深度的影响。
![样本A中gene的表达量是样本B的两倍,但是这是由测序深度引起的结果,而非真实存在的差异。](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/1f036817479a2aa9984c156b2e305d9d.png)
样本A中gene的表达量是样本B的两倍,但是这是由测序深度引起的结果,而非真实存在的差异。
![在这里插入图片描述](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/bfedb410be0e66bf8e1d0f2b82f425b3.png)
基因X和Y的真实表达量是一致的,但是基因X的reads会比Y的多,这是由于X基因长度更长导致的。
只想了解每个gene被覆盖到的相对reads数,而不做gene长度矫正![在这里插入图片描述](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/2285664d016ebd78011791071b4b63e1.png)
都做
![在这里插入图片描述](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/09534a4631e8910b4c597f500ad2f51b.png)
这个人讲的挺好,有例子