R语言实现并行计算[parallel,Rdsm]

最新推荐文章于 2024-07-16 10:56:33 发布
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分类专栏： 计算机 R 文章标签： 多线程 算法
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_44813954/article/details/105849183
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本文介绍了在R语言中使用parallel包进行并行计算，包括创建线程集群、共享变量和函数，以及批处理函数的应用。同时，讨论了Rdsm包在共享内存并行计算中的作用，强调了通信开销和调度策略的重要性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

R语言实现并行计算[parallel,Rdsm]

最近在R中的学习并行计算
整个人被各种函数整的头都大了
所以准备专门写一条博文来总结
所谓R中的并行无非是
snow包multicore包和foreach包
但很遗憾的是只有第一个能够在win下运行
辅助并行计算的共享内存包rdsm也只能在linux或者macos上运行

然而在macos上安装r和rstudio是十分痛苦的
说实话碰到了装成日文版等等各种问题
最后还是没有解决rstudio无法运行的结果，故只能在r中调试
如果有大佬解决了相关情况希望也ballball孩子
(console不可以通过，terminal可以通过）
最终所有实验还是在ubuntu上做的

话不多说，在r语言中parallel包里

parallel包

创建一个两个线程的集群:

cls<-makeCluster(2)

当然使用完毕需要释放这个集群:

stopCluster(cls)

将”lnks”变量分享给整个cls集群:

clusterExport(cls,”lnks”)

同理将函数function分享给整个cls集群:

clusterEvalQ(cls
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狸猫跑团屋
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专栏目录
R语言并行运算
Mrrunsen的博客
01-20 2181
R语言运行通常只会占用cpu一个核，并未充分利用电脑cpu的性能。 以parallel包运行过程为例，通常多核运算的过程如下： 启动多核进程，对每个核心进行初始化 将数据分发给每个核心 将任务平均分配给每个核心，并把代码传递给每个核心 等待所有核心完成任务，并从每个核心提取结果 停止多核进程 这个时候或许有人问，如果分配的任务数多于核心数，怎么整？此时程序等待首批分配任务的核心完成工作以后再分配给它们，是不是像流水线上的工人一样（老资本家了）。 今天以u
R语言中的并行计算汇总
默默耕耘，阶段爆发，取长补短，修炼身心
02-26 6462
上一篇博文：R语言中的代码运算性能提升 R语言运行在CPU单核单线程上，使用并行计算原因是程序运行时间太长。大部分程序都可以进行并行化改造以提高运算性能 1.lapply 只需要一个参数(list\vector\array\matrix\data.frame)，和一个以该参数为输入的函数，函数返回列表list lapply(1:3/3, round, digits=3); [[1]] ...
R语言中的并行计算实现
辉的博客
07-29 8519
并行计算有显性并行和隐式并行， 隐式并行：OpenBLAS，Intel MKL，NVIDIA cuBLAS，H2O(参考我的博客)等 显性并行：parallel（主打lapply应用）、foreach（主打for循环）、SupR、还有利用GPU的办法（gpuR） 介绍可以参考： https://cosx.org/2016/09/r-and-parallel-computing https://bl...
R语言学习笔记8-并行计算
最新发布
weixin_42333247的博客
07-16 369
在R语言中，通过并行计算可以显著提升处理大数据集或执行耗时任务的效率。R提供了多种并行计算的方法，包括使用基础的parallel包和更高级的foreach和future包。future包提供了一种更为高级和灵活的并行计算方式，它允许异步执行任务，并能够轻松地在本地或远程集群中进行任务调度。foreach包结合doParallel包提供了更加方便的接口来实现并行计算，特别适用于迭代式任务的并行化处理。在上述例子中，foreach()函数用于并行迭代计算，.combine参数指定了如何合并各个迭代的结果。
R语言--并行计算(parallel、foreach包)
jhr112的博客
01-06 1万+
​R语言是单核计算语言，在数据建模或计算过程中，常常出现相同或相似任务的重复计算，一般操作是for循环处理或采用apply族函数处理，为了更快完成计算，采用并行计算是更优的选择。 本文采用R语言中的parallel包与foreach包实现并行计算，并针对单变量并行和多变量并行计算这两个常用场景做了函数封装。 0.环境&软件 win1064bit R3.6.1 ...
R语言并行计算的原理和案例(foreach,parallel)
陈陈的专栏
04-20 1万+
参考网址众所周知，在大数据时代R语言有两个弱项，其中一个就是只能使用单线程计算。但是R在2.14版本之后，R就内置了parallel包，强化了R的并行计算能力。 parallel包实际上整合了之前已经比较成熟的snow包和multicore包，multicore无法在windows下运行。parallel包可以很容易的在计算集群上实施并行计算，在多个CPU核心的单机上，也能发挥并行计算的功能。我们
R语言：并行计算
偷闲阁
08-23 4605
一直以来，总觉得并行计算是种很高深的技术，需要系统性的学习才能掌握。直到最近工作中进行大量循环计算，动辄十几个小时，实在是被整崩溃了，于是百度了一下，惊喜的发现R有很傻瓜的并行计算用法，完全满足基本的计算需求，这里简单记录一下。 R语言的并行可以用parallel包，这个包是自带的，不用下载，直接library即可。它本质上相当于打开多个R控制台，然后将任务拆分后让这些控制台计算，等各部分计算完成后再合在一起呈现出来。 完成一次并行计算需要的函数主要有：makeCluster、clusterExport
R语言并行计算提高速度丨parallel包和foreach包
青笋的博客
09-12 4388
处理循环中出现错误时的应对方法，默认为stop，即出现错误就停止，但是这样会导致已经计算的内容全部失效，还得重新算。另外还有两种方式，remove选项可以在遇到错误时自动移除错误项，pass可以在出现错误时跳过该项，后者的区别是会记录出现错误的位置。今天与大家分享的是R语言中的并行计算的内容，将探讨如何使用parallel和foreach包在R中进行并行计算，以及在不同情况下提高计算效率的方法。在R中尽量避免使用for循环，在R中使用for循环速度很慢，在写代码的时候，应该尽可能的避免使用for循环。
R语言 并行处理
自由 平等~忠诚 奉献
06-17 1万+
具体的不懂，只记录实现 parallel packageR自带的包，可以实现并行处理。library(parallel) detectCores(logical = F) #获得实际核数 cl <- makeCluster(getOption("cl.cores", 4)) # 设置并行核数为4 clusterExport(cl=cl, varlist=c("text.var", "ntv", "
R语言提交后台任务Rstudio\nohup
青笋的博客
10-07 2157
在使用Rstudio过程中，如果已经写好了一个脚本，但是运行该脚本需要很长的时间，那么最好的方式就是提交到后台运行，点击Rstudio左下角的Background jobs按钮，可以看到新的窗口。在进行大规模数据分析时，R语言提供了后台计算的功能，能将计算任务提交到后台执行，不影响当前窗口的活动，而且不会受到网络波动导致任务中断，提交后就不用盯着一直看，后台运行就可以下班。通过后台计算可以在计算任务运行的同时，继续进行其他操作，提高了效率，希望本文对你理解和使用R语言后台计算有所帮助。
r语言 并行_并行R概括地说
weixin_26742939的博客
09-07 1121
r语言 并行Loops are, by definition, repetitive tasks. Although it is not part of the definition, loops also tend to be boring. Luckily for us, computers are good at performing repetitive tasks, and they n...
掌握并行计算：R语言中的parallel与foreach包实战教程
mengpf的博客
10-29 417
今天，我们将探索R语言中两个强大的并行计算工具——parallel包和foreach包，学习如何有效地缩短程序运行时间，让计算飞起来！parallel包是R语言的基础包之一，支持在单台机器的多个核心上进行并行计算，特别适合于多核CPU的计算机。foreach是一个外部包，它提供了一个新的循环结构，可以轻松地进行并行化操作，且语法简洁。与传统的for循环相比，foreach不仅语法更清晰，而且并行化更简单。通过简单的修改，计算立即利用了所有可用的CPU核心！一、parallel包：多核心处理的利器。
R语言并行计算实战教程
neweastsun的专栏
06-09 1410
%do% 和 %dopar% 是对遍历对象执行一段业务功能代码的操作。 其中ex是表达式，在foreach循环环境中会被运行多次，%do%串行执行，%dopar%并行执行。 执行ex的结果默认作为list类型返回，我们通过.combine参数指定返回结果类型。c用于连接执行结果为向量类型，‘cbind’ 和 ‘rbind’ 合并向量为矩阵类型，‘+’ 和 ‘*’ 用于处理数值类型。 并行执行 在执行并行计算之前，需要声明集群，即告诉R我们有多个核（cpu）。具体步骤如下：其中type可以为,前者创建新的se
R语言【parallel】——使用集群的使用操作
whitedrogen的博客
02-28 604
这些函数提供了几种使用集群并行化计算的方法。 Arguments 参数【cl】：一个集群对象，由这个包或包snow创建。如果为NULL，则使用已注册的默认集群。参数【fun，FUN】：函数或命名函数的字符串。参数【expr】：表达式求值。参数【seq】：向量分割。参数【varlist】：要导出的对象名称的字符向量参数【envir】：从中导出变量的环境参数【x】：一个用于clusterApply和clusterApplyLB的向量，一个用于parRapply和parcapapply的矩阵。参数【...】
R中两种常用并行方法——1. parallel
热门推荐
Kanny
08-16 1万+
由于最近在进行一些论文的模拟，所以尝试了两种并行的方法：parallel与snowfall，这两种方法各有优缺，但还是推荐snowfall，整体较为稳定，不容易因为内存不足或者并行线程过多等原因而报错。 在模拟时什么地方可以用到并行？ 并行操作一般适用于重复的操作，比如重复随机按照相同分布生成数据，然后分别同时进行模拟。这里就可以用并行。亦或者我们要做permutation计算p-valu...
【R语言】parallel实现多线程
weixin_43840576的博客
08-31 2620
R语言使用parallel实现并行运算parallel的用法小小建议 由于最近用R语言跑的数据比较多，且都是重复的操作，跑一次时间长，所以尝试了下并行运算，所用的包为parallel，使用简单，易于上手。 parallel的用法 parallel包的用法非常简单，我们只需要将原本的apply()改为parApply()，lapply()改为parLapply()，然后在函数前面加上初始化线程和结束线程的语句即可。 我们可以通过detectCores()来检查我们自己电脑（或者服务器）的总线程数，并对其进行
Parallel R编程指南：实现高效并行计算
书中可能包含了并行计算的基础理论、R语言的相关库和函数、并行编程模型，以及实际案例分析等内容，旨在帮助读者掌握在R中实现并行计算的方法和技术。" 在当前的科技领域，数据量日益增大，传统的串行计算已经无法...
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