plot_pseudotime_heatmap报错Error in intI(i, n = x@Dim[1], dn[[1]], give.dn = FALSE) : invalid chara

a=c("SLC31A2","GCNT1","RAB10","HBA2","EBI3","C1QC")

plot_pseudotime_heatmap(HSMM[a,],
                     num_clusters = 1,
                       cores = 1,

                        show_rownames = T,cluster_rows = F)

报错

Error in intI(i, n = x@Dim[1], dn[[1]], give.dn = FALSE) : 
  invalid character indexing

原因a向量中有部分基因不在HSMM的行名中

which(!(a%in%rownames(HSMM)))

解决办法,删除这部分基因即可。

  • 1
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值