R中heatmap如何保存图片

于 2023-07-09 23:00:03 发布
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f=Heatmap(data)
)
pdf("heatmap.pdf",width=14,height = 6)
draw(f)
dev.off()

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r中heatmap.2的美化
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在R中使用heatmap.2画热图时，可以通过以下方式进行美化： 1. 修改颜色方案：可以使用colorRampPalette函数生成自定义的颜色方案，然后通过col参数进行设置。也可以使用预定义的颜色方案，例如rainbow、heat.colors等。 2. 调整标签字体大小和角度：可以使用cexRow和cexCol参数来调整行和列标签的字体大小，使用lhei和lwid参数来调整标签的高度和宽度，使用lmat参数来调整标签的位置。可以使用las参数来调整标签的角度。 3. 去除边框和网格线：可以使用border和trace参数将边框和网格线设置为透明。 4. 调整图像大小和比例：可以使用width和height参数来调整图像的大小，使用symm参数来控制是否对称显示。 5. 添加图例：可以使用key参数添加图例，通过key.title参数设置图例的标题，通过key.xlab和key.ylab参数设置图例的横轴和纵轴标签。 下面是一个示例代码： ```R library(gplots) # 生成数据 data(mtcars) mtcars_matrix <- as.matrix(mtcars) # 绘制热图 heatmap.2(mtcars_matrix, scale = "column", col = colorRampPalette(c("blue", "white", "red"))(100), trace = "none", dendrogram = "column", margins = c(10, 10), cexRow = 0.5, cexCol = 0.5, lhei = c(0.5, 4), lwid = c(0.5, 4), las = 2, key = TRUE, key.title = "Legend", key.xlab = "X Axis", key.ylab = "Y Axis", symm = TRUE, density.info = "none", main = "Heatmap of mtcars", xlab = "Cars", ylab = "Features") ``` 运行以上代码，你可以得到一个美化过的热图。
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