转录组-PCA分析

PCA分析步骤：

第一步，对所有样本进行中心化

第二步，求特征协方差矩阵

第三步，求协方差矩阵的特征值和特征向量

第四步，将特征值按照从大到小的顺序排序，选择其中最大的k个，然后将其对应的k个特征向量分别作为列向量组成特征向量矩阵

第五步，将样本点投影到选取的特征向量上(用欧氏距离方程计算点间距离)

getwd()

#导入三张表

gene_exp<-read.csv("gene_exp.csv",header = T,row.names = 1)
gene_info<-read.csv("gene_info.csv",header = T,row.names = 1)
sample_info<-read.csv("sample_info.csv",header = T,row.names = 1)

#BiocManager::install("PCAtools