注释表中提取特定的OTU注释行

起因是笔者选取了otu table中的部分otu，另外有全部otu的注释表(taxonomy)，有些分析需要保证otu table中的otu数目和taxonomy中otu数目一致，不然就会出现以下报错

接下来是我原始的数据格式

otu table

taxonomy表格

所以目的就是筛选taxonomy中的ASV，让它跟otu表格是能对应上的

用了如下代码

#导入两个表格
species <- read.csv("otutable.txt",header=T,sep="",row.names=1)
taxa <-read.csv("taxonomy.txt",header=T,sep="",row.names=1)
#筛选
taxa1=taxa[c(rownames(species)),] 

略做学习记录，欢迎交流指正