基于python的计算基因组_【ROSALIND】【练Python,学生信】05 计算DNA序列GC含量

该博客介绍了如何使用Python计算DNA序列的GC含量,包括FASTA格式的理解,定义读取FASTA文件的函数,以及计算GC含量的函数。通过实例展示了如何找出GC含量最高的序列及其含量。
摘要由CSDN通过智能技术生成

题目:

计算DNA序列GC含量(Computing GC content)

Given: At most 10 DNA strings in FASTA format (of length at most 1 kbp each).

所给:不超过10条DNA序列,每条最少1kbp,以FASTA格式提供。

Return: The ID of the string having the highest GC-content, followed by the GC-content of that string. Rosalind allows for a default error of 0.001 in all decimal answers unless otherwise stated; please see the note on absolute error below.

需得:GC含量最高序列的ID,以及其GC含量。允许误差0.001。

测试数据

>Rosalind_6404

CCTGCGGAAGATCGGCACTAGAATAGCCAGAACCGTTTCTCTGAGGCTTCCGGCCTTCCC

TCCCACTAATAATTCTGAGG

>Rosalind_5959

CCATCGGTAGCGCATCCTTAGTCCAATTAAGTCCCTATCCAGGCGCTCCGCCGAAGGTCT

ATATCCATTTGTCAGCAGACACGC

>Rosalind_0808

CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGAC

TGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT

  • 0
    点赞
  • 11
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值