Galaxy基础教程：从数据集合中过滤样本

我们将多个样本的测序数据构建成一个数据集合（List of Dataset Pairs）用于流程分析，但有可能个别样本的测序数据有问题，这时候我们如何从集合中删除该问题样本呢？

比如有这样一个数据集合：

现在想过滤掉第1个样本：SRR6357071，可以这样操作：

1. 将样本信息存入一个文件

点击 Upload Data：

在弹出的界面中：

• 点击 粘贴数据或链接

• 粘贴 SRR6357071

• 点击 开始

完成上述操作后，会在右侧历史记录 Panel 看到一个新的文件：Pasted Entry

其内容为：SRR6357071

2. 过滤数据集合

左侧工具 Panel，搜索工具：Filter collection

参数设置：

• Input Collection *：3 PE Fastqs

• How should the elements to remove be determined?：Remove if identifiers are PRESENT in file

• Filter out identifiers absent from *: Pasted Entry

原集合将会被拆分成2个新的集合：

filtered：包含过滤后剩下的样本。

discarded：包含过滤掉的样本。

后续就可以对集合中剩下的样本进行数据分析了。

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