GEO基因芯片数据处理精华（一）：GEOquery包

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GEO(Gene Expression Omnibus)是NCBI(美国国家生物信息中心)下的基因表达数据库，包括各种各样的基因芯片检测技术得到的试验记录与平台信息。GEO是最具知名度的基因表达数据存储数据库，这些数据包括单通道和双通道的微阵列实验，测量对象包括mRNA, 基因组cDNA, 蛋白质冗余物，以及各种非阵列技术，例如，高通量测序技术。现在，我们介绍GEO数据库的检索、下载，以及数据的预处理方法。首先，我们介绍GEO数据集查询R语言包——GEOquery.

GEOquery包的下载与安装

GEOquery包位于生物信息开源软件库Bioconductor, 在Bioconductor主页的搜索栏输入GEOquery回车后，出现了下载项。