如何解决生物软件报错问题

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经常有人截一张或几张生物软件报错的图给我，咨询一下错误原因，一般面对这种情况，我的内心都是奔溃的，尤其是我在手机上看的时候，因为屏幕太小，看不清。即使看清了，我也不知道什么原因。因为，我还做不到图像识别，看到什么软件报错，都能立刻给出原因，但是可以给出一些建议啊……

处理软件错误分为两步：
第一，诊断原因；
第二，寻找解决方案。

软件为何会出错？
在命令行模式下运行生物软件，主要考虑三个因素。软件，输入文件，选项参数。那么可能出错的地方也就在此。部分情况下也可能是硬件问题，比如资源不足。

1、command not found
这样的错误，原因就是软件没有安装，或者是软件路径没有写正确，还有一种可能是软件名写错了，或者没有区分大小写；

解决方案：
1、检测软件是否安装正确，有可执行程序，使用全路径试一下；
2、将软件可执行程序路径添加到.bashrc 文件中的PATH变量中

2、No such file or directory
如果敲软件名，软件可以运行，或者之前软件都可以运行，那么绝大部分就是输入文件的问题。输入文件经常出现“No such file or directory”，这就是因为输入文件路径写错了，在R语言中“Error: object ‘x’ not found”的错误与之类似。那么检查一下这个对象是否存在，是否有值。

解决方