2021.01.05丨根据基因名称拼接表达量与相关注释

这一步是在进行最后的数据汇总工作中用到的,将基因的count与FPKM值和基因注释的结果组合在一起,得到一个完整的数据。方便客户进行后续研究。算法与之前那篇基因ID匹配注释文本一文相似,用了两个for循环嵌套进行比对,O=n²,在此也希望能够抛砖引玉,得到大神指点。

输入文件:

anno.DEG.txt

all.anno.xls #这里用的Editplus打开

本来之前我对all.anno.xls的geneID已经处理过了,但是正好遇到ftp出问题,无法下载最新文件,就将就前两天的结果进行处理

#读取文件列
anno_file = open('C:/Users/bbplayer/Downloads/all.anno.x
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

穆易青

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值