![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756922.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
bug记录
穆易青
心之所向,行之所为
展开
-
2022.11.21【bug笔记】|bam文件报错:Cannot add sequence that already exists in SAMSequenceDictionary
sam文件是通过hisat2,bowtie2或者bwa将rawdata进行比对后得到的包含比对信息的数据格式。经过samtools处理后得到的bam文件经常用于后续分析,比如RNA-seq分析时,可以统计序列的插入片段也可以做后续定量,WGS流程里比对后生产的bam文件也可以去冗余获取snp位点。原创 2022-11-21 17:23:36 · 634 阅读 · 3 评论 -
2022.11.15【bug笔记】|Error in FASTQ file at line 55: Line expected to start with ‘+‘, but found ‘G‘
今天协助销售处理客户一个质控分析问题,感觉很多人都会遇到,在这里记录一下。原创 2022-11-15 20:37:29 · 667 阅读 · 0 评论 -
2022.04.15【单细胞】|Seurat安装,C++ compiler supports the long long type... no解决方法
最近学习单细胞转录组(scRNA)分析,这个分析需要提前安装R4.0还有Seurat等R包进行分析,同事在创建新环境后正常情况下都可以顺利安装,然而到我这边,似乎是缺少某一个lib依赖库,没法成功安装。原创 2022-04-15 15:40:46 · 1975 阅读 · 0 评论 -
2022.01.20【bug笔记】| qiime2报错:An error was encountered while running DADA2 in R (return code 1)
项目场景:版本介绍:qiime2:2021.4DADA2:1.18.0R:4.0.3项目场景:使用qiime2过程中,执行dada2命令对测序数据进行特征序列分类时,发生报错。问题描述:之前没有对qiime2有过更新或者修改,突然出现以下报错An error was encountered while running DADA2 in R (return code 1), please inspect stdout and stderr to learn more.打开记录日志原创 2022-01-20 14:53:05 · 4422 阅读 · 4 评论 -
2021.11.23【bug笔记】丨picard运行报错:Exception in thread “main“ java.lang.UnsupportedClassVersionError
项目场景:RNA-seq对比对后bam文件绘制insert图片问题描述:执行picard命令时发生报错:JAVA报错代码: at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method) at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800) at java.security.SecureClassLoader.defineClass(SecureClassLoader.java:1原创 2021-11-23 22:16:11 · 1189 阅读 · 0 评论