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单细胞
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穆易青
心之所向,行之所为
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2022.04.15【单细胞】|Seurat安装,C++ compiler supports the long long type... no解决方法
最近学习单细胞转录组(scRNA)分析,这个分析需要提前安装R4.0还有Seurat等R包进行分析,同事在创建新环境后正常情况下都可以顺利安装,然而到我这边,似乎是缺少某一个lib依赖库,没法成功安装。原创 2022-04-15 15:40:46 · 1975 阅读 · 0 评论 -
2022.04.14【读书笔记】|转录因子分析
转录因子(transcription factors, TFs)是直接作用于基因组,与特定DNA序列结合,调控DNA转录过程的一类蛋白质原创 2022-04-14 15:42:57 · 2601 阅读 · 0 评论 -
2022.04.14【读书笔记】|WGCNA分析原理和数据挖掘技巧
WGCNA,全称weighted gene co-expression network analysis,即权重基因共表达网络分析。自2005年B Zhang, S Horvath等提出,在疾病以及其他性状与基因关联分析等方面的研究中被广泛应用。原创 2022-04-14 15:19:46 · 4152 阅读 · 3 评论 -
2022.04.13【读书笔记】|10X单细胞转录组分析流程介绍
本次笔记是基迪奥单细胞课程第二章,根据课件以及上课老师的情况来看,比之前的美格和菲沙都要好一些,而且价格更优惠。从官网也可以看到基迪奥在培训这方面是作为重点业务。等上完剩余课程,我会进行一个简单的小结,来评估几个公司之间的课程质量。原创 2022-04-14 11:41:00 · 2306 阅读 · 0 评论 -
2022.04.11【读书笔记】|单细胞转录组概述
文章目录摘要研究意义转录组学意义技术比较研究方法细胞筛选文库构建测序实验方法实验流程常见问题分析内容(重点)分析内容总览细胞亚群分类细胞类型频率统计Marker基因分析富集分析样本差异分析逆时分析WGCNA细胞通讯分析转录因子分析总结摘要本篇笔记为基迪奥单细胞转录组第一节课程笔记,感觉他们家的课程比之前的同行水平要高一些,并且价格公道,整体课程性价比较高,鼓励大家学习,这里记录一下课程重点。研究意义转录组学意义作为DNA到蛋白质的枢纽(中心法则),其高通量分析的实现性和可解读性较强。技术比较普原创 2022-04-11 16:06:32 · 759 阅读 · 0 评论