- sRNAnalyzer是分析smallRNA的一个流程工具,它集合了cutadapt、bowtie、fastx_toolkit三个工具,并根据用户的需要提供了参考基因组和对应config。
- 对三个软件安装好之后,试运行工具,样品去接头工作结束后会发生报错,报错内容如下:
- 似乎是缺失了.fa文件导致后续分析无法进行,即使这样,在路径下仍然会生成两个Report文件,其中一份是cutadapt的结果文件,另一个(XX_Cutadapt_Prinseq. report)文件中会有另一个报错
- Can't locate Digest/MD5.pm in @INC (@INC contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl5 /usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5 /usr/share/perl5 .) at - line 693
- 发现文件没有生成的原因是MD5模块缺失导致脚本终止。
- 初步尝
2021.01.12【perl】丨Can‘t locate Digest/MD5.pm in @INC ,sRNAnalyzer的Digest/MD5缺失报错解决办法
最新推荐文章于 2023-05-31 11:05:50 发布