读书笔记:《生物信息学与功能基因组学》第九章(上篇)
第九章概述
第九章专注于蛋白质结构及其与结构基因组学的关系。本章深入讨论了蛋白质的三维构象如何决定其功能,以及如何通过实验和计算方法来预测和确定蛋白质结构。
9.1 蛋白质结构与结构基因组学概要
- 结构决定功能:蛋白质的三维结构是其功能的基础。
- 高分辨率蛋白质结构数量:已知结构远少于序列数量,这限制了我们对蛋白质功能的理解。
- 结构基因组方法:与传统方法相反,结构基因组学首先预测蛋白质编码区,然后通过实验或计算方法确定其结构。
9.1.1 蛋白质结构,同源和功能基因组学
- 功能预测:通过已知功能的蛋白与未知蛋白的同源性来进行功能预测。
- 序列与结构的保守性:在某些情况下,结构比序列更为保守。
9.1.2 结构基因组学提出的问题:载脂蛋白家族
- 载脂蛋白家族:探讨了载脂蛋白家族的结构和功能