2024.05.27【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第九章 蛋白质结构与结构基因组学 中）【AI测试版】

读书笔记：《生物信息学与功能基因组学》第九章（中篇）

9.2.1 在NCBI访问PDB记录

• NCBI的PDB访问: 介绍了如何在NCBI数据库中获取蛋白质结构信息，包括通过Structure页面搜索或利用蛋白质相似性搜索。
• PDB记录的链接: 讨论了如何通过Entrez蛋白质数据库中的"Related Structures"链接或blastp搜索来找到PDB结构。

9.2.2 蛋白质折叠类型概况

• 蛋白质分类系统: 探讨了蛋白质折叠类型的问题，以及如何通过数据库如SCOP、CATH、Dali、FSSP等来研究蛋白质的折叠空间。

9.2.2.1 蛋白质分类系统：SCOP数据库

• SCOP数据库: 详细讨论了SCOP数据库的结构，这是一个基于分级分类系统的蛋白质结构和进化关系的综合描述数据库。

9.2.2.2 CATH数据库

• CATH数据库: 描述了CATH数据库，这是一个关于所有已知蛋白质结构域的分级分类系统，强调了其