【实验技术笔记】Western Blotting 实验操作要点及数据分析


1. 样品制备

  • ① 裂解
    细胞弃培养上清无菌 PBS 清洗 1-2 遍(去除细胞和培养皿表面残留的培养基,因为培养基中血清含有丰富蛋白质),加入细胞裂解液(80-100ul/60mm dish) 和蛋白酶抑制剂,置摇床上摇动裂解,注意随时观察。最好冰上裂解(摇床上放冰盒,培养皿放在冰盒中)。
    组织将组织块切割成合适大小,无菌 PBS 漂洗 1-2 遍,加入细胞裂解液和蛋白酶抑制剂,高速匀浆机匀浆(低温匀浆:装有组织块的 2ml 平底 EP 管外面套一个装满碎冰的小烧杯)或高通量组织破碎仪破碎(提前预冷裂解液,把破碎过程分成几段,缩短每一小段的破碎时间,破碎的间隙把装有组织的 EP 管埋在碎冰里降温几分钟,再接着下一小段的破碎过程)。最好低温裂解
  • ② 去除碎片(充分裂解细胞或组织后,会有一些细胞碎片没办法完全溶解在裂解液中,需要去除):4℃下 12000rpm 离心 10-20min,取上清。(离心后细胞碎片沉在管底,上清中是抽提出的蛋白)
  • ③ 蛋白定量BCA 法测定蛋白浓度后分装。
  • ④ 蛋白变性:加 loading buffer,沸水浴煮 5min。(沸水浴容易把 EP 管盖冲开,为了防止污染,也可以用金属浴或 PCR 仪来使蛋白变性。)
  • ⑤ 保存:分装变性后的蛋白质样品-20℃保存,长期保存-80℃。也可以一裂解完就冻存在-80℃,样品凑齐后再拿出来一起做去碎片、定量、变性等后续步骤。
  • 推荐试剂:
    碧云天,Western 及 IP 细胞裂解液(P0013) 裂解
    Pierce™ BCA Protein Assay Kit(23227) 蛋白浓度测定,推荐用 96 孔板+酶标仪来做,省试剂(一孔 200ul BCA 工作液),省事省时间(酶标仪一扫,把数据贴到 excel 里,就能算出每个蛋白的浓度,还可以第一次计算时保存好模板,下次直接往模板里填数据就能得到各个浓度和每管分装体积)。
    BCA 法标曲制作:(官方说明书操作较复杂,简化一下)试剂盒自带的 BSA 标准品浓度是 2ug/ul,设标曲梯度:准备 7 个孔,每孔依次加入 20, 19,18,17,16,15,14 ul 去离子水,0,1,2,3,4,5,6ul BSA 标准品,因此得到的标曲的蛋白点就是 0,2,4,6,8,10,12ug (可以覆盖普通裂解液蛋白抽提范围,超高浓度的蛋白不适用)。
    在这里插入图片描述
    Sigma,Sample Buffer, Laemmli 2× Concentrate(S3401) 蛋白变性,蛋白沉底好,不容易飘,上样顺畅。缺点:2×的,所以只适用于蛋白浓度高的样品。只是普通蛋白抽提也可以用碧云天(国货精品)的 loading buffer。

2. SDS-PAGE 胶制作及电泳分离

2.1 灌胶

在这里插入图片描述

  • ① 洗玻璃板:玻璃板有不同规格的,能制备不同厚度的 PAGE 胶,要注意选择合适的制胶玻璃板,在制胶前,要使用洗涤剂充分洗净玻璃板和制胶梳子,去离子水冲洗数遍,把玻璃片斜靠在网篮里自然晾干,注意不要有水渍。
  • ② 装配制胶架:玻璃板应该是配对的(一片是带玻璃直角的厚板,一片是平滑的薄板),把配对的玻璃板对好,保持两片玻璃板的底边在同一水平面,用制胶支架固定住,再安装到固定架上。注意制胶支架松紧度(紧)、制胶固定架上的夹子上的弹簧的弹性(紧)以及固定架上胶条是否干净,是否具有很好的回弹力,灌胶时要时刻注意是否漏胶如果稍有些漏,可以在固定架上卡一个 1ml 枪头,如上图,可以人为把固定架上的夹子弄紧一点。如果漏得厉害,就没辙了,只能重新把这一套组装起来。所以最好是同时
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