同位素标记测定未知代谢物的先新方法
特征代谢的确切机制及其在植物进化中的重要性仍然是个谜。特征代谢的产物及其相应的生物合成基因对于理解某些代谢普遍存在的原因至关重要。尽管基于质谱(MS)的代谢组学使我们能够获得未知特征代谢物、已知代谢物及其对应异构体或类似物的结构特征数据,但分析方法的拓展仍然十分必要。在此,回顾总结了使用稳定同位素标记识别未知特征代谢物的先进分析方法。
迄今,地球上大约391000种维管植物中的225种基因组已被测序。由于测序及数据分析技术方法的进步,预计这一数字在不久的将来会迅速增加。现代基因组测序能做到一个物种的全基因组分析或染色体规模的基因组分析。这些方法可用于从测得的基因组中获得相关代谢类型的详细信息。
植物有两种代谢类型,即初级代谢,次级代谢或特殊代谢。初级代谢对于维持植物的生存十分必要,其与包括氨基酸、糖、脂肪酸和脂类在内的代谢物息息相关,且在进化早期即形成,存在于所有已知的植物中。而植物进化出特殊代谢的原因尚不明确;过去十年的研究表明,特殊代谢产物能保护植物抵抗环境胁迫,包括生物和非生物胁迫。为了确定特殊代谢物的作用,对相关生物合成基因修饰或缺失导致缺乏此类特殊代谢物的植物进行比较分析是必不可少的。例如,通过对比野生型和突变体的类黄酮生物合成途径,能阐明代谢物对氧化和干旱相关胁迫的作用。各种野生型物种的比较遗传分析揭示了酰化类黄酮对紫外线-B具有缓解作用,表明当植物暴露在严重的胁迫下时,它们会过度产生特殊的代谢物,表现出一定的缓解胁迫的能力。
已有研究表明,参与代谢的剩余基因仍然存在于基因组中;然而,由于对应代谢物未被识别,对应基因的功能因此也未能被确认。因此,要确定相应基因的功能,必须揭示相应的代谢物。每一种植物有自己的“特殊代谢组”,其由特殊代谢物组成。植物界中至少有391000个这样的特殊代谢组。我们应该发展分析方法去识别尽可能多的特殊代谢组。MS是获取全面代谢组学数据的有力工具。串联质谱&#