熟练掌握R语言的Meta分析全流程和不确定性分析,并结合机器学习等方法讲解Meta分析在文献大数据的延伸应用

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Meta分析是针对某一科研问题,根据明确的搜索策略、选择筛选文献标准、采用严格的评价方法,对来源不同的研究成果进行收集、合并及定量统计分析的方法,最早出现于“循证医学”,现已广泛应用于农林生态,资源环境等方面。R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制,可以对数据直接进行分析和显示,命令格式简单、结果可读性强,包含众多针对Meta分析软件包,是进行Meta整合分析及评价的有效平台。本次针对Meta分析原理、公式、操作步骤及结果分析,进阶应用进行详细解析,结合多个例子,熟练掌握Meta分析全流程和不确定性分析,并结合机器学习等方法讲解Meta分析在文献大数据的延伸应用

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一 Meta分析的选题与检索

1 Meta分析的选题与文献检索

1) 什么是Meta分析

2) Meta分析的选题策略

3) 文献检索数据库

4) 精确检索策略,如何检索全、检索准

5) 文献的管理与清洗,如何制定文献纳入排除标准

6) 文献数据获取技巧

7) 文献计量分析CiteSpace及研究热点分析

二、Meta分析与R语言基础

2 Meta分析的常用软件与R语言基础

1) R语言做Meta分析的优势及其《Nature》、《Science》经典案例应用

2) R语言基本操作

3) R语言数据清洗方法

4) R语言Meta分析常用包及相关插件介绍与安装

从自编程计算到调用Meta包(meta、metafor、dmetar、esc、metasens、metamisc、meta4diag、gemtc、robvis、netmeta、brms等),全程分析如何进行meta计算、meta诊断、贝叶斯meta、网状meta、亚组分析、meta回归及作图。

三、R语言Meta分析与作图

3 R语言Meta分析

1) R语言Meta分析的流程

2) 各类meta效应值和累计效应值计算

连续资料的RR、MD与SMD

分类资料的RR和OR

3) Meta亚组分析

4) R语言图形可视化基础

5) 如何用ggplot2绘制漂亮的森林图

四、R语言Meta回归分析

4 R语言Meta回归分析

1) Meta回归统计分析理论及应用

2) Meta回归和普通回归分析的异同

3) 固定效应与随机效应分析

4) 泡泡图(bubble)的绘制

五、R语言Meta诊断分析

5 R语言Meta诊断进阶

1) Meta诊断分析(t2、I2、H2、Q等统计量)

2) 异质性检验

3) 敏感性分析

4) 偏倚分析

5) 风险分析

六、R语言Meta分析的不确定性

6 R语言Meta分析的不确定性

1) 网状Meta分析

2) 贝叶斯理论

3) R语言贝叶斯工具Stan、JAGS和brms

4) 贝叶斯Meta分析及不确定性分析

七、机器学习在Meta分析中的应用

7 机器学习在Meta分析中的应用

1) 机器学习基础以及Meta机器学习的优势

2) Meta加权随机森林(MetaForest)的使用

3) 使用Meta机器学习对文献中的大数据进行整合

4) 使用机器学习进行驱动因子分析

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