5+非肿瘤+铁死亡+实验验证生信思路解析

最新推荐文章于 2025-04-25 20:21:53 发布

生信风暴

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文章标签：零知识证明

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研究表明铁死亡在椎间盘退变（IDD）中发挥关键作用。通过基因表达分析，鉴定出80个与铁死亡相关的差异表达基因，涉及铁死亡反应、TNF信号通路等多个通路。关键基因如KEAP1、MAPK1、HSPA5等的表达变化影响IDD进程，且在体外细胞模型中得到验证。这些发现为IDD的诊断和治疗提供了新策略。

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今天给同学们分享一篇非肿瘤+铁死亡+实验验证的生信文章“Identification and validation of ferroptosis-related gene signature in intervertebral disc degeneration”，这篇文章于2023年2月6日发表在Front Endocrinol (Lausanne)期刊上，影响因子为5.2。

下背痛（LBP）是导致老年人残疾的主要原因，而椎间盘退变（IDD）是导致下背痛的主要因素。铁死亡反应是一种新发现的程序性细胞死亡，其特点是依赖铁的致命脂质过氧化反应。越来越多的证据表明，铁死亡反应在各种人类疾病中发挥着重要作用。然而，IDD 中铁细胞凋亡的潜在机制仍然难以捉摸。本研究旨在全面揭示铁死亡在IDD发病和进展过程中的关键作用。

1. 确定与铁死亡相关的差异表达基因

首先，作者根据 GSE56081 数据集筛选出了 IDD 与对照组相比的差异表达基因（DGEs）。火山图显示共有 2269 个差异表达基因，包括 847 个下调基因和 1422 个上调基因（图 1A）。随后，作者将 IDD 中的 DGEs 与基于 FerrDb 数据库的铁死亡相关基因进行了交叉。如文氏图（图 1B）所示，共确定了 80 个铁变态反应相关差异表达基因（铁死亡差异基因）。分层聚类热图显示，IDD 组与对