参考意义大。4+巨噬细胞相关生信思路,简单易复现。



今天给同学们分享一篇生信文章“Angiogenesis regulators S100A4, SPARC and SPP1 correlate with macrophage infiltration and are prognostic biomarkers in colon and rectal cancers”,这篇文章发表在Front Oncol期刊上,影响因子为4.7。

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结果解读:

高S100A4 mRNA表达是一个强有力的预测因子,与癌症类型无关,预示着较短的生存率


作者应用Cox回归分析、ROC分析和Kaplan-Meier曲线来评估S100A4在结直肠癌(CRC)总体组、结肠癌(CC)患者和直肠癌(RC)患者的疾病预后的重要性。在每个组中,根据ROC分析确定的截断意义,将所有患者根据S100A4表达分为高风险组和低风险组,以预测总体死亡、疾病相关死亡、复发和进展。Kaplan-Meier生存曲线显示,S100A4高风险组(>截断值)的CRC患者相比低风险组(<截断值)具有更短的总生存期(OS)(p=0.0159)、疾病特异性生存期(DSS)(p<0.0001)、无病生存期(DFS)(p<0.0001)和无进展生存期(PFS)(p<0.0001)(图1A)。对于结肠癌和直肠癌患者的OS、DSS、DFS和PFS,结果也相似(图1B、C),表明S100A4 mRNA表达的预后意义不依赖于癌症类型。

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SPARC mRNA表达升高是结肠癌而非直肠癌预后不良的准确独立预测因子

SPAR

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