【软件安装】GROMACS 的安装

Aurora_i

于 2025-05-11 17:58:57 发布

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分类专栏： Linux软件安装文章标签：学习方法

本文链接：https://blog.csdn.net/Aurora_i/article/details/147874746

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本文介绍了如何在 Ubuntu 22.04 服务器下安装 GROMACS-2024.5 GPU 加速版本，具体操作方法如下：

一、下载前置库文件和软件

sudo apt install build-essential libxml2-dev libssl-dev libpng-dev libgsl-dev libblas-dev liblapack-dev

sudo apt install cmake gcc g++

在指定位置下载 gromacs-2024.5.tar.gz

sudo wget https://ftp.gromacs.org/gromacs/gromacs-2024.5.tar.gz

在这里插入图片描述

tar xfz gromacs-2024.5.tar.gz

在这里插入图片描述

cd gromacs-2024.5

在这里插入图片描述

mkdir build
cd build

在这里插入图片描述

cmake .. -DGMX_GPU=CUDA -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/home/program/gromacs/gromacs-2024.5

在这里插入图片描述

make -j 4

在这里插入图片描述

make check

在这里插入图片描述

sudo make install

在这里插入图片描述

返回上一级目录，生成 bin 文件夹且其中含有 GMXRC 文件，则视为安装成功

cd ../bin
ls

在这里插入图片描述

vi ~/.bashrc

在 .bashrc 文件末尾加入：

#GROMACS-2024.5
export PATH=$PATH:/home/program/gromacs/gromacs-2024.5/bin

激活环境变量：

source ~/.bashrc

gmx --version

在这里插入图片描述

至此，Ubuntu 22.04 服务器中的 GROMACS-2024.5 GPU 版本已全部配置安装完毕！
（此文有各种命令参考：https://manual.gromacs.org/2024.5/install-guide/index.html#）